More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4357 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4357  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 822 aa  1574    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  43.5 
 
 		 3400 aa  336  9e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 		 7110 aa  309  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  40.07 
 
 		 3408 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  36.16 
 
 		 3508 aa  308  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  36.11 
 
 		 2108 aa  308  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  39.97 
 
 		 2126 aa  304  6.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  37.05 
 
 		 4151 aa  302  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  40.64 
 
 		 6768 aa  301  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  35.41 
 
 		 1789 aa  294  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  40.82 
 
 		 4607 aa  294  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  36.01 
 
 		 1601 aa  291  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  36.71 
 
 		 1584 aa  291  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  38.72 
 
 		 2966 aa  290  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  36.45 
 
 		 2277 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  38.38 
 
 		 7279 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.89 
 
 		 1305 aa  286  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 5154 aa  280  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  39.8 
 
 		 3158 aa  280  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  38.15 
 
 		 3355 aa  278  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.07 
 
 		 1867 aa  274  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  38.02 
 
 		 1831 aa  273  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  37.31 
 
 		 3494 aa  273  8.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  39.63 
 
 		 3254 aa  273  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  37.63 
 
 		 5255 aa  268  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  35.9 
 
 		 3449 aa  266  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  36.46 
 
 		 1114 aa  265  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  36.56 
 
 		 1593 aa  264  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 3874 aa  260  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  37.81 
 
 		 3493 aa  260  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  35.07 
 
 		 3930 aa  260  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  41 
 
 		 2846 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  34.01 
 
 		 1820 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  35.33 
 
 		 7210 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  38.29 
 
 		 4930 aa  255  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  34.6 
 
 		 4111 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  35.9 
 
 		 2020 aa  254  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 1837 aa  253  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 3092 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  38.38 
 
 		 1924 aa  251  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  39.82 
 
 		 4575 aa  249  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 		 5400 aa  247  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  34.27 
 
 		 3670 aa  244  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4359  Acyl transferase  37.17 
 
 		 3208 aa  242  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  38 
 
 		 3148 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  34.61 
 
 		 1548 aa  238  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 		 1816 aa  238  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  34.99 
 
 		 1602 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  34.21 
 
 		 4080 aa  236  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  38.14 
 
 		 2090 aa  235  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3890  erythronolide synthase  32.73 
 
 		 765 aa  234  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000750553  normal  0.261243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  33.73 
 
 		 2066 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  32 
 
 		 1101 aa  234  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  30.92 
 
 		 3711 aa  229  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  33.85 
 
 		 2376 aa  226  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  34.89 
 
 		 2374 aa  226  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  35.04 
 
 		 1143 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  36.49 
 
 		 2107 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  32.87 
 
 		 2719 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  39.49 
 
 		 5526 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  33.39 
 
 		 3463 aa  218  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  30.8 
 
 		 3033 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  32.87 
 
 		 1017 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  31 
 
 		 3693 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  31 
 
 		 3693 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  33.65 
 
 		 2847 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  31.96 
 
 		 3702 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  32.63 
 
 		 2085 aa  210  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  32.63 
 
 		 2085 aa  210  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  32.63 
 
 		 2085 aa  210  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  31.72 
 
 		 4882 aa  210  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  31.91 
 
 		 3281 aa  209  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.56 
 
 		 1126 aa  208  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.54 
 
 		 3696 aa  207  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  31.71 
 
 		 2111 aa  206  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  30.73 
 
 		 2230 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  32.61 
 
 		 1573 aa  203  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  32.59 
 
 		 2367 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  28.11 
 
 		 1587 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  29.07 
 
 		 1939 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  32.9 
 
 		 2220 aa  198  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  32.56 
 
 		 2113 aa  197  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  31.81 
 
 		 2081 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  34.18 
 
 		 2890 aa  195  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  30.24 
 
 		 3676 aa  194  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  29.34 
 
 		 1812 aa  194  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  31.34 
 
 		 1822 aa  194  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  31.97 
 
 		 4264 aa  193  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  31.63 
 
 		 1805 aa  193  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  29.09 
 
 		 1656 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  31.2 
 
 		 3679 aa  192  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  33.05 
 
 		 2666 aa  192  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  25.25 
 
 		 1087 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  31.44 
 
 		 1071 aa  191  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  32.93 
 
 		 2060 aa  190  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  31.2 
 
 		 2108 aa  190  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  30.99 
 
 		 2162 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  31.35 
 
 		 4840 aa  185  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  30.55 
 
 		 2232 aa  185  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 		 2551 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>