More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4359 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4359  Acyl transferase  100 
 
 		 3208 aa  6061    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  37.33 
 
 		 4080 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  39.52 
 
 		 3493 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  38.55 
 
 		 2847 aa  377  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  38.7 
 
 		 1593 aa  367  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  35.41 
 
 		 1584 aa  360  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  36.57 
 
 		 6768 aa  356  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  33.33 
 
 		 2277 aa  352  9e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  34.93 
 
 		 2846 aa  347  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  35.66 
 
 		 1601 aa  345  7e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  35.61 
 
 		 3158 aa  328  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  46.45 
 
 		 2090 aa  317  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  37.93 
 
 		 3400 aa  313  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  34.23 
 
 		 2666 aa  311  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  36.04 
 
 		 3281 aa  311  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  47.48 
 
 		 3670 aa  310  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  31.79 
 
 		 2719 aa  307  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  37.86 
 
 		 1548 aa  306  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  45.45 
 
 		 2966 aa  302  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  36.11 
 
 		 4840 aa  301  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  42.66 
 
 		 2126 aa  300  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  42.79 
 
 		 2108 aa  299  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 		 7110 aa  298  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  37.23 
 
 		 7279 aa  298  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  45.37 
 
 		 3408 aa  286  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  42.48 
 
 		 3508 aa  285  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  39.49 
 
 		 2020 aa  285  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.63 
 
 		 1305 aa  285  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.86 
 
 		 2762 aa  284  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  32.29 
 
 		 5526 aa  278  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  44.01 
 
 		 4607 aa  274  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.08 
 
 		 1867 aa  273  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  43.08 
 
 		 3930 aa  272  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  41.63 
 
 		 3449 aa  272  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  40.09 
 
 		 4151 aa  268  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 1955 aa  267  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.44 
 
 		 3092 aa  264  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  42.74 
 
 		 3711 aa  264  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  40.52 
 
 		 7210 aa  263  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  25.13 
 
 		 1559 aa  260  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  42.69 
 
 		 1820 aa  259  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  35.3 
 
 		 1573 aa  257  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  42.06 
 
 		 5154 aa  257  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  38.44 
 
 		 3355 aa  255  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  39.68 
 
 		 1114 aa  255  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  24.92 
 
 		 1559 aa  254  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  42.68 
 
 		 3254 aa  254  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  40.41 
 
 		 3494 aa  253  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  39.36 
 
 		 5255 aa  253  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  34.22 
 
 		 3033 aa  250  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  42.5 
 
 		 2107 aa  250  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  33.48 
 
 		 3427 aa  247  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  37.1 
 
 		 1789 aa  244  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  42 
 
 		 3463 aa  243  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4357  Beta-ketoacyl synthase  37.33 
 
 		 822 aa  242  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  39.51 
 
 		 1831 aa  239  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  33.6 
 
 		 2024 aa  233  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 3874 aa  232  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  40.52 
 
 		 1143 aa  232  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.47 
 
 		 2136 aa  228  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  35.15 
 
 		 1077 aa  228  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  46.97 
 
 		 4575 aa  226  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2974  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  45.87 
 
 		 2719 aa  226  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  42.18 
 
 		 3424 aa  224  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 1144 aa  223  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  43.66 
 
 		 3148 aa  222  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  31.02 
 
 		 2880 aa  222  8.999999999999998e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.87 
 
 		 1939 aa  221  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  36.25 
 
 		 4882 aa  218  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  31.18 
 
 		 1577 aa  217  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 5400 aa  216  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.1 
 
 		 1822 aa  215  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  36.7 
 
 		 2066 aa  214  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  42.41 
 
 		 4930 aa  214  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  41.62 
 
 		 2232 aa  214  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  42.27 
 
 		 2113 aa  213  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  31.62 
 
 		 1520 aa  212  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  31.62 
 
 		 1520 aa  212  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.21 
 
 		 3111 aa  211  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  37.76 
 
 		 4264 aa  207  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  32.55 
 
 		 1017 aa  207  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  36.43 
 
 		 3101 aa  207  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  36.49 
 
 		 2230 aa  206  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  39.44 
 
 		 1924 aa  206  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  39.95 
 
 		 2220 aa  205  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  35.47 
 
 		 2225 aa  204  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  32.45 
 
 		 1580 aa  202  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  32.45 
 
 		 1580 aa  202  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  27.05 
 
 		 1087 aa  202  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  38.98 
 
 		 4183 aa  202  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  30.72 
 
 		 2547 aa  200  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  38.23 
 
 		 2374 aa  200  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  32.43 
 
 		 1580 aa  199  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  39.86 
 
 		 2376 aa  199  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.17 
 
 		 1804 aa  198  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  30.29 
 
 		 1581 aa  197  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  33.26 
 
 		 2333 aa  196  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  28.54 
 
 		 1653 aa  196  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.97 
 
 		 1816 aa  196  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  39.88 
 
 		 2085 aa  196  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>