91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4231 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  100 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  63.49 
 
 		 189 aa  224  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  59.26 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  55.32 
 
 		 190 aa  201  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  56.68 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  52.41 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  54.74 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  50.52 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  48.33 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  41.15 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  38.22 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  42.68 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 202 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  35.67 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  35.03 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  35.03 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 197 aa  87  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  33.55 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.94 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 256 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 283 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 263 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  35.42 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 221 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 310 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 255 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 250 aa  44.7  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  44.7  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1651  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 255 aa  44.7  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.925362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 424 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  25.77 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 272 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 242 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 255 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 207 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 234 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.12 
 
 		 190 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 232 aa  41.6  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 259 aa  41.6  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 265 aa  41.2  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 226 aa  41.2  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 319 aa  41.2  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 150 aa  40.8  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 295 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>