More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0258 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  100 
 
 		 395 aa  779    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  62.09 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  47.97 
 
 		 397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  46.7 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  47.97 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  47.97 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  47.97 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  48.35 
 
 		 397 aa  306  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  46.09 
 
 		 401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.51 
 
 		 392 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.59 
 
 		 397 aa  298  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.92 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  44.02 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  40.1 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.26 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  42.13 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  41.03 
 
 		 392 aa  255  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.92 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  39.53 
 
 		 394 aa  249  8e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  40.42 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  40.05 
 
 		 397 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.76 
 
 		 395 aa  232  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  37.06 
 
 		 402 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  42.67 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.88 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.91 
 
 		 391 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  32.8 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.67 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  32.8 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  32.88 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.32 
 
 		 389 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  37.24 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1904  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.17 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0620222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  38.46 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  34.31 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.29 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.62 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.92 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  36.54 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  36.54 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  29.24 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  30.19 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  34.97 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  32.99 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  35.26 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.43 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.56 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  31.25 
 
 		 464 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  29.32 
 
 		 484 aa  66.2  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.67 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2284  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.68 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  30.29 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  37.27 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.28 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2063  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.51 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239523  hitchhiker  0.000119694 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  32.19 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.15 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  33.1 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3344  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.81 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  36.26 
 
 		 529 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  28.5 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  32.19 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  30.29 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  32.34 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  30.99 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  30.93 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.3 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  35.67 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  29.76 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  30.59 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  30.28 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.72 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.12 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  32.62 
 
 		 513 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  30.59 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1324  2-alkenal reductase  31.84 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.12 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  27.78 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.35 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  34.9 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2702  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.44 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.351014  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  32.68 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1143  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.12 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  31.82 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  29.23 
 
 		 525 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  33.93 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  34.93 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.41 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  31.94 
 
 		 673 aa  61.6  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  35.37 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  32.24 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2482  hypothetical protein  31.15 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000886741 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  34.93 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0739  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.93 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  27.27 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  30.22 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22490  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  29.44 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  31.18 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  27.24 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  32.75 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>