77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2482 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2482  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  990    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000886741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  31.15 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  26.16 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1578  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.36 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.5845  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  30.5 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.63 
 
 		 506 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  26.4 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  32.18 
 
 		 394 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  24.43 
 
 		 264 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  27.57 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.88 
 
 		 364 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  23.95 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1244  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.74 
 
 		 330 aa  50.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.68 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.41 
 
 		 408 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  24.72 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  22.97 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  25.9 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  28.27 
 
 		 383 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  27.85 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3890  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.78 
 
 		 317 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.06 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  24.47 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  22.97 
 
 		 458 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.73 
 
 		 435 aa  48.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2772  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.32 
 
 		 355 aa  47.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643545  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.8 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1292  serine protease HtrA, putative  23.26 
 
 		 412 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  26.9 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  26.04 
 
 		 384 aa  47.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.12 
 
 		 392 aa  47.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  25.79 
 
 		 374 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  29.44 
 
 		 393 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  23.03 
 
 		 415 aa  47  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.02 
 
 		 415 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1808  trypsin-like serine protease  27.49 
 
 		 285 aa  47  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000335064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  22.35 
 
 		 424 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0024  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.55 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.78 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  21.29 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  25.44 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.94 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1716  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  23.11 
 
 		 280 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.319195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  23.71 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1783  2-alkenal reductase  24.32 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1818  2-alkenal reductase  24.32 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  23.66 
 
 		 772 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.18 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  24.86 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.13 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  27.16 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  25.44 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  25.27 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  24.87 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.44 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  23.95 
 
 		 375 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3244  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.37 
 
 		 321 aa  45.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  23.6 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1243  2-alkenal reductase  26.38 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.904095  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  25.44 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1175  2-alkenal reductase  26.38 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  23.81 
 
 		 462 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.41 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 403 aa  44.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  22.51 
 
 		 518 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4430  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.82 
 
 		 338 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  25.41 
 
 		 473 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  25.36 
 
 		 476 aa  44.3  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25 
 
 		 377 aa  43.9  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1313  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.63 
 
 		 264 aa  43.9  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  26.63 
 
 		 485 aa  43.9  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  27.33 
 
 		 397 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  26.85 
 
 		 370 aa  43.5  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  25.61 
 
 		 489 aa  43.5  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  26.78 
 
 		 475 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25 
 
 		 545 aa  43.1  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.6 
 
 		 417 aa  43.1  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>