More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1645 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  100 
 
 		 354 aa  707    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  34.76 
 
 		 354 aa  192  5e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  34.15 
 
 		 377 aa  192  8e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  34.35 
 
 		 478 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  34.86 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  32.81 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  35.09 
 
 		 483 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  30.73 
 
 		 356 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  30.14 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  30.98 
 
 		 409 aa  166  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  33.76 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  32.29 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  30.59 
 
 		 402 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  28.3 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  29.97 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  27.6 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.54 
 
 		 375 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 426 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  29.65 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  24.26 
 
 		 333 aa  116  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  26.26 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  21.43 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  24.67 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  28.87 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  28.25 
 
 		 349 aa  99.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  26.46 
 
 		 361 aa  99.4  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 353 aa  99.4  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.89 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 354 aa  97.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  25 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.11 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  25.54 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  25.22 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 307 aa  93.2  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  24.64 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  24.72 
 
 		 427 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  28.84 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  27.52 
 
 		 333 aa  90.1  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  24.43 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 299 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.86 
 
 		 381 aa  87  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1789  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein, putative  32.85 
 
 		 268 aa  87  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 389 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.86 
 
 		 389 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1604  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein, putative  32.85 
 
 		 268 aa  86.3  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  25.77 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  29.02 
 
 		 682 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.42 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.77 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.77 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  25.86 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  24.32 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  24.43 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  24.73 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  29.91 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  24.43 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  27.74 
 
 		 682 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  24.43 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  27.05 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  22.79 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1972  putative hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  31.88 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3530  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.374472  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.07 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  27.12 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  23.73 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  27.21 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  23.91 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  24.94 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  26.46 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  22.52 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1285  periplasmic binding protein  27.44 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000393821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  23.94 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  22.25 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  24.53 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  21.9 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2195  periplasmic binding protein  30.38 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0123698  normal  0.456206 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  24.83 
 
 		 322 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  23.8 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  22.86 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  22.61 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0648  hemin-binding periplasmic protein HmuT  28.84 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  23.8 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  30.08 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  24.21 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  23.12 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  21.24 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  23.68 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0124  periplasmic binding protein  29.35 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00000158909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>