More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1604 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1604  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein, putative  100 
 
 		 268 aa  523  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1789  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein, putative  97.39 
 
 		 268 aa  507  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1972  putative hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  96.64 
 
 		 268 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0648  hemin-binding periplasmic protein HmuT  39.93 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0585  periplasmic binding protein  36.95 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1763  hemin-binding periplasmic protein HmuT  43.13 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  27.97 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  32.39 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  30.59 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06810  Periplasmic binding protein  27.24 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.8 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.24 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  29.82 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.55 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 321 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  26.77 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.29 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0962  periplasmic binding protein  30.2 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  29.29 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 337 aa  89.7  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 288 aa  89.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  27.41 
 
 		 300 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  28.17 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  23.95 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  28.94 
 
 		 294 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.06 
 
 		 313 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  32.85 
 
 		 354 aa  86.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.63 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  30.71 
 
 		 341 aa  85.5  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.53 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1056  hypothetical protein  24.89 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  26.41 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.19 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.19 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  26.02 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4079  periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000203821  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  32.54 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  25.98 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  23.77 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  24.7 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11530  hypothetical protein  24.89 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  25.49 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  25.3 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  26.19 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  23.77 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 312 aa  78.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  27.8 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3099  vitamin B12-transporter protein BtuF  23.9 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  24.03 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1178  vitamin B12-transporter protein BtuF  24.81 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.54 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0117  periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  25 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1923  periplasmic binding protein  25.29 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3444  periplasmic binding protein  30.56 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0163  vitamin B12-transporter protein BtuF  30.56 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0162  vitamin B12-transporter protein BtuF  30.56 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0170  vitamin B12-transporter protein BtuF  30.56 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1133  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0168  vitamin B12-transporter protein BtuF  30.56 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3501  vitamin B12-transporter protein BtuF  30.56 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00157  vitamin B12-transporter protein BtuF  30.56 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  23.92 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00156  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  27.05 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.93 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3846  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.907593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  27.73 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  25 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  23.43 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  28.93 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004473  vitamin B12 ABC transporter B12-binding component BtuF  25.66 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  24.16 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  22.59 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2820  periplasmic binding protein  25.31 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00857628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  28.97 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01625  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.21 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  25.46 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  27.45 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  23.36 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1492  periplasmic binding protein  24.21 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.285572  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  29.96 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  26.6 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>