261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2953 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  100 
 
 		 147 aa  288  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  45.24 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  42.97 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  42.19 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  45.04 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  39.85 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  42.54 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  40.77 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  44.88 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  42.28 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  43.31 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  47.66 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  36.36 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  44.44 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  44.44 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  43.31 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  37.8 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  44.44 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  42.15 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  40 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  42.14 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  40.46 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  42.52 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  40 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  38.89 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  41.54 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  44.88 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  39.37 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  39.46 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  38.13 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  46.09 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  38.93 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  44.09 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  36.09 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  39.84 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  38.4 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  39.39 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  40.44 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  40.16 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  35.25 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  40.16 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  40.16 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  39.72 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  40.16 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  38.46 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  43.2 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  41.23 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  40.94 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  39.19 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  43.22 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  41.73 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  38.58 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  38.3 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  37.69 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  36.64 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  38.58 
 
 		 147 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  38.58 
 
 		 147 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  38.58 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  39.57 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  35.35 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  36.72 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  28.1 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  38.35 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  40.5 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  38.89 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  41.27 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  37.96 
 
 		 170 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  34.13 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  36.45 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  39.56 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  39.66 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  36.59 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  35 
 
 		 378 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  40.52 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  37.59 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  38.54 
 
 		 204 aa  57  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  34.09 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  33.87 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  44.16 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1322  DoxX  35.94 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  34.75 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  36.88 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  34.69 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2663  DoxX family protein  46.77 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0368307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  34.69 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  33.98 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  34.69 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  36.96 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  34.69 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  31.75 
 
 		 281 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  41.61 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  36.29 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  31.34 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  35.16 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  39.85 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  39.13 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  29.93 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  35.16 
 
 		 198 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  41.53 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  43.02 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>