More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3086 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3086  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 695 aa  1360    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  39.84 
 
 		 788 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  38.34 
 
 		 836 aa  296  9e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0430  LuxR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 845 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.32699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0443  LuxR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 845 aa  274  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0453  LuxR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 845 aa  274  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00902802  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10344  transcriptional regulator  34.96 
 
 		 832 aa  268  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0620  response regulator receiver protein  37.75 
 
 		 843 aa  257  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  35.99 
 
 		 833 aa  253  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1635  LuxR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 818 aa  180  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1650  regulatory protein, LuxR  35.31 
 
 		 794 aa  177  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315022  normal  0.343942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.33 
 
 		 881 aa  60.1  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  35.62 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  35.77 
 
 		 893 aa  58.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 973 aa  57.4  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  44.29 
 
 		 917 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  49.02 
 
 		 937 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 881 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  40.24 
 
 		 959 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 995 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 881 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 981 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 876 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  40.66 
 
 		 900 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 910 aa  54.3  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 218 aa  54.3  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 1074 aa  53.9  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 814 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 755 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  32.41 
 
 		 218 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 220 aa  53.5  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  38.33 
 
 		 318 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 344 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  42.65 
 
 		 574 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 212 aa  53.9  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 217 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 213 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  38.96 
 
 		 977 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5845  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 219 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 223 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0316  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 341 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 201 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0327  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 341 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 994 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 208 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0338  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 341 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17340  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  47.27 
 
 		 232 aa  53.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 956 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  43.14 
 
 		 231 aa  52.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  42.42 
 
 		 91 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 218 aa  52.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 916 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 251 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4366  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 225 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 242 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 251 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  42.42 
 
 		 90 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 210 aa  52  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 212 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2543  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 217 aa  52  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473476  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  52  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  38.3 
 
 		 867 aa  51.6  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  44.44 
 
 		 567 aa  52  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 189 aa  52  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3183  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 191 aa  51.6  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 196 aa  51.2  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 876 aa  51.2  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 232 aa  51.2  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 209 aa  51.2  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  45.1 
 
 		 963 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.74 
 
 		 200 aa  51.2  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 225 aa  51.2  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 916 aa  51.2  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 217 aa  50.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 201 aa  50.8  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 506 aa  50.8  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.1 
 
 		 214 aa  50.8  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 215 aa  50.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 967 aa  50.8  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  30.77 
 
 		 887 aa  50.8  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  50 
 
 		 232 aa  50.8  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  40 
 
 		 304 aa  50.8  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1291  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 300 aa  50.8  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.979242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 232 aa  50.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0606  transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 506 aa  50.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  42.11 
 
 		 943 aa  50.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  35 
 
 		 913 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  36.92 
 
 		 957 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 303 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 200 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 936 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 209 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1152  LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 181 aa  50.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 301 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  36.99 
 
 		 216 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  45.1 
 
 		 516 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.51 
 
 		 517 aa  50.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1549  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 238 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 894 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>