More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3813 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  52.11 
 
 		 338 aa  271  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  53.57 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 281 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  53.17 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  52.73 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  53.17 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  53.91 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  52.63 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  52.63 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 277 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4268  GntR domain-containing protein  52.59 
 
 		 264 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000808968  hitchhiker  0.000533508 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  51.17 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  40.17 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  37.04 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  36.93 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  33.61 
 
 		 248 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  37.24 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  30.45 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0763  GntR domain-containing protein  34.92 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 259 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  29.39 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 247 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.72 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.81 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  28.46 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  31.88 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  28.83 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  26.58 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  30.14 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  29.87 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  32.48 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0868  regulatory protein GntR, HTH  28.37 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  27.39 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  37.42 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  26.82 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 230 aa  72  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  29.63 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.06 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  27.73 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  26.18 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  30.87 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  26.75 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0841  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  27.27 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  27.27 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  27.27 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  27.27 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  27.27 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  27.27 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  27.27 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  27.27 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4074  GntR domain-containing protein  27.78 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  27.27 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.17 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.17 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  29.95 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  29.27 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  27.91 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3218  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 340 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00133147  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.28 
 
 		 263 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  31.03 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2324  regulatory protein  32.14 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1917  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000235972  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  27.78 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  31.07 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  26.25 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  32.59 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  28.25 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.93 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.13 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  28.15 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1686  regulatory protein GntR HTH  35.24 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00156623  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  26.7 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>