252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3539 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  54.19 
 
 		 205 aa  216  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  59.39 
 
 		 202 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  58.88 
 
 		 202 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  52.13 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 198 aa  197  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 198 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  54.87 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 210 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  47.78 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  51.01 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3641  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  45.18 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  43.85 
 
 		 187 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0771  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  35.94 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  25.22 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 236 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 271 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 330 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 273 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  33.77 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 317 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>