101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1674 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1674  cytochrome c class I  100 
 
 		 128 aa  254  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1598  cytochrome c, class I  96.09 
 
 		 128 aa  183  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2277  cytochrome c, class I  95 
 
 		 128 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  44.44 
 
 		 664 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  42.72 
 
 		 653 aa  82  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  41.11 
 
 		 652 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  43.33 
 
 		 647 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  37.61 
 
 		 254 aa  76.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  41.49 
 
 		 657 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  36.63 
 
 		 645 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  40.43 
 
 		 254 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  39.36 
 
 		 653 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 647 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  40.66 
 
 		 631 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  37.08 
 
 		 643 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  40.66 
 
 		 636 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  41.11 
 
 		 629 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  39.6 
 
 		 642 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  34.44 
 
 		 644 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  39.56 
 
 		 647 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  36.28 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  34.83 
 
 		 649 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  35.96 
 
 		 640 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  35.96 
 
 		 642 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  35.96 
 
 		 642 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  35.96 
 
 		 640 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  36.96 
 
 		 702 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  36.96 
 
 		 702 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.93 
 
 		 637 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  41.18 
 
 		 632 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  38.46 
 
 		 632 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  35.05 
 
 		 571 aa  60.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  32.26 
 
 		 652 aa  60.1  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  36.67 
 
 		 652 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  33.33 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  29.81 
 
 		 683 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  36.67 
 
 		 633 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  35.56 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2859  hypothetical protein  29.67 
 
 		 307 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0235479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  37.36 
 
 		 687 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  36.63 
 
 		 181 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  32.98 
 
 		 286 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  43.48 
 
 		 683 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  32.56 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0775  class I monoheme cytochrome c  51.11 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0404  hypothetical protein  53.33 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1798  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.29 
 
 		 292 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 207 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6691  hypothetical protein  39.29 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2431  class I monoheme cytochrome c  51.11 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0928963  normal  0.0529755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  32.32 
 
 		 339 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  28.26 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  33.94 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  28.46 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  32.17 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  26.92 
 
 		 248 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  33 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  28.71 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0574  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  31.33 
 
 		 615 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 220 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  31.31 
 
 		 329 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  32.98 
 
 		 350 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  28.26 
 
 		 206 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  30.43 
 
 		 197 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  27.66 
 
 		 193 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  25.81 
 
 		 190 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  25.81 
 
 		 190 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  25.81 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  31.07 
 
 		 212 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  29.29 
 
 		 231 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  25.69 
 
 		 173 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.71 
 
 		 293 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  42.86 
 
 		 374 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  26.19 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 388 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  24.47 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  29.9 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0462  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.71 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528353  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  29.25 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  29.36 
 
 		 200 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  28.43 
 
 		 201 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  31.25 
 
 		 177 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  28.42 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  32.06 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5620  cytochrome c, mono-and diheme variant-like protein  31.11 
 
 		 398 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  34.25 
 
 		 320 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  30.95 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.53 
 
 		 298 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  29.73 
 
 		 204 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  34.38 
 
 		 528 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  27.91 
 
 		 476 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  26.6 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  50 
 
 		 398 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  28.57 
 
 		 731 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  27.55 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  33.67 
 
 		 511 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>