32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6691 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6691  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  346  9e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1415  cytochrome c class I  38.64 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3282  cytochrome c, class IC  32.95 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2649  cytochrome c, class IC  31.58 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 248 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  33 
 
 		 296 aa  51.2  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  34.33 
 
 		 637 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  34.82 
 
 		 286 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  34.04 
 
 		 683 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  38.18 
 
 		 653 aa  45.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  44.19 
 
 		 652 aa  45.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2859  hypothetical protein  39.68 
 
 		 307 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0235479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  43.59 
 
 		 683 aa  45.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  47.62 
 
 		 254 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  29.31 
 
 		 146 aa  44.3  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  31.4 
 
 		 633 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  30.09 
 
 		 304 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0574  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  34.55 
 
 		 615 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  29.29 
 
 		 314 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  35.87 
 
 		 687 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  50 
 
 		 643 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  28.28 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  33.71 
 
 		 224 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  31.4 
 
 		 652 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 644 aa  42.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  26.88 
 
 		 193 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  32.58 
 
 		 649 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  37.04 
 
 		 571 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  30 
 
 		 629 aa  41.2  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4164  hypothetical protein  38.71 
 
 		 147 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.277093  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.2 
 
 		 304 aa  40.8  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  27.34 
 
 		 166 aa  40.8  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>