14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3282 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3282  cytochrome c, class IC  100 
 
 		 118 aa  243  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2649  cytochrome c, class IC  86.44 
 
 		 118 aa  218  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1415  cytochrome c class I  43.68 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6691  hypothetical protein  32.95 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  34.94 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  39.02 
 
 		 314 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4638  cytochrome c, class I  31.13 
 
 		 361 aa  47.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  29.76 
 
 		 286 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  29.91 
 
 		 466 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  31.25 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2585  cytochrome c class I  28.75 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4164  hypothetical protein  33.94 
 
 		 147 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.277093  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  28.71 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>