70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6394 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  100 
 
 		 687 aa  1374    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0069  hypothetical protein  32.72 
 
 		 434 aa  181  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  35.68 
 
 		 314 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  32.64 
 
 		 296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  31.51 
 
 		 254 aa  110  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2859  hypothetical protein  34.65 
 
 		 307 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0235479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  33.78 
 
 		 683 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  25.84 
 
 		 457 aa  86.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3059  hypothetical protein  27.66 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  24.15 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  45.11 
 
 		 664 aa  68.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  30.25 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  27.68 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  22.6 
 
 		 490 aa  66.6  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  26.67 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1762  hypothetical protein  26.82 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  28.63 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  21.6 
 
 		 595 aa  63.2  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  23.64 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  37.96 
 
 		 645 aa  60.8  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2674  hypothetical protein  24.66 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  39.44 
 
 		 571 aa  60.8  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  37.82 
 
 		 636 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  36.8 
 
 		 254 aa  59.7  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  22.59 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  25.38 
 
 		 248 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  37.82 
 
 		 647 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  31.98 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  36.13 
 
 		 647 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2450  hypothetical protein  24.72 
 
 		 408 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  29.46 
 
 		 329 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  32.26 
 
 		 643 aa  56.2  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  35.66 
 
 		 629 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  29.91 
 
 		 339 aa  54.7  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  39.45 
 
 		 644 aa  54.3  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  40.35 
 
 		 657 aa  54.3  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31.9 
 
 		 653 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 631 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  40.17 
 
 		 652 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3444  hypothetical protein  25 
 
 		 459 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166801  normal  0.529515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  39.45 
 
 		 649 aa  52  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4251  cytochrome c class I  27.11 
 
 		 286 aa  51.2  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0839506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  35.29 
 
 		 632 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4120  hypothetical protein  24.44 
 
 		 324 aa  50.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.609345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  38.89 
 
 		 647 aa  50.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0574  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  38.27 
 
 		 615 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6691  hypothetical protein  34.19 
 
 		 171 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  35.65 
 
 		 640 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  36.28 
 
 		 388 aa  47.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  28.95 
 
 		 146 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  34.78 
 
 		 642 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  34.4 
 
 		 632 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4029  hypothetical protein  25.29 
 
 		 324 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.879477  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  34.78 
 
 		 642 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0999  hypothetical protein  23.83 
 
 		 368 aa  46.6  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  31.48 
 
 		 652 aa  45.8  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  34.33 
 
 		 175 aa  45.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 270 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  33.61 
 
 		 633 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  28.86 
 
 		 379 aa  45.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 394 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  34.78 
 
 		 642 aa  45.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  34.78 
 
 		 640 aa  44.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  34.82 
 
 		 393 aa  44.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  36.97 
 
 		 195 aa  44.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  32.5 
 
 		 511 aa  44.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  27.14 
 
 		 499 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  32.79 
 
 		 652 aa  44.3  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  35.51 
 
 		 175 aa  44.3  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  32 
 
 		 171 aa  43.9  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>