More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0150 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  53.96 
 
 		 771 aa  808    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  51.99 
 
 		 766 aa  792    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  70.66 
 
 		 772 aa  1059    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  79.85 
 
 		 789 aa  1251    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  54.03 
 
 		 773 aa  804    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  78.75 
 
 		 789 aa  1249    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  69.04 
 
 		 795 aa  1058    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  52.45 
 
 		 771 aa  785    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 775 aa  1576    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  53.9 
 
 		 773 aa  802    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  39.01 
 
 		 711 aa  346  8e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  35.34 
 
 		 672 aa  345  2e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  34.64 
 
 		 698 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  34.6 
 
 		 655 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  31.86 
 
 		 686 aa  246  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  33.26 
 
 		 668 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  31.94 
 
 		 676 aa  216  9e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  32.75 
 
 		 677 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  31.42 
 
 		 680 aa  207  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  28.35 
 
 		 640 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  31.42 
 
 		 680 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  30.91 
 
 		 731 aa  200  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  28.91 
 
 		 753 aa  193  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  30.32 
 
 		 573 aa  190  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  29.38 
 
 		 550 aa  117  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.07 
 
 		 739 aa  109  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  26.08 
 
 		 744 aa  107  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  35.11 
 
 		 725 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.54 
 
 		 763 aa  103  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  47.15 
 
 		 749 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.02 
 
 		 806 aa  102  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  27.92 
 
 		 713 aa  102  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.77 
 
 		 756 aa  102  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  28.49 
 
 		 743 aa  100  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  26.92 
 
 		 754 aa  100  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.9 
 
 		 718 aa  99.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4753  AAA ATPase central domain protein  27.42 
 
 		 646 aa  99  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  33.63 
 
 		 570 aa  99  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  41.26 
 
 		 580 aa  99  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.99 
 
 		 754 aa  99.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  26.36 
 
 		 703 aa  98.6  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.42 
 
 		 754 aa  98.6  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.53 
 
 		 755 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.27 
 
 		 727 aa  97.8  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  38.12 
 
 		 578 aa  96.7  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.47 
 
 		 810 aa  97.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  35.95 
 
 		 646 aa  97.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  40.56 
 
 		 569 aa  97.1  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  25.7 
 
 		 721 aa  96.3  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  41.22 
 
 		 657 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.51 
 
 		 805 aa  96.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  41.22 
 
 		 653 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.05 
 
 		 740 aa  95.5  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.68 
 
 		 740 aa  95.5  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.95 
 
 		 738 aa  95.9  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.36 
 
 		 742 aa  95.1  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  40.48 
 
 		 1085 aa  95.1  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.43 
 
 		 719 aa  94.4  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  26.58 
 
 		 826 aa  94.4  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  38.06 
 
 		 652 aa  94.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  30.36 
 
 		 570 aa  93.2  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.77 
 
 		 808 aa  94  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.17 
 
 		 742 aa  93.6  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  30.36 
 
 		 570 aa  93.6  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  30.36 
 
 		 570 aa  93.2  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  38.52 
 
 		 450 aa  92.8  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  42.65 
 
 		 665 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  37.58 
 
 		 617 aa  93.2  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.82 
 
 		 704 aa  92.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  43.09 
 
 		 687 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.31 
 
 		 753 aa  92  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.1 
 
 		 738 aa  92.4  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  39.31 
 
 		 656 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  39.01 
 
 		 662 aa  91.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  35.09 
 
 		 442 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.64 
 
 		 757 aa  92  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.36 
 
 		 743 aa  92  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  41.04 
 
 		 619 aa  92  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  37.04 
 
 		 450 aa  91.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.36 
 
 		 757 aa  91.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  37.78 
 
 		 787 aa  91.3  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  41.94 
 
 		 305 aa  91.3  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.31 
 
 		 773 aa  91.3  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  25.63 
 
 		 567 aa  91.3  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.83 
 
 		 805 aa  91.3  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  39.16 
 
 		 639 aa  91.3  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  38.31 
 
 		 577 aa  90.1  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.05 
 
 		 757 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 		 680 aa  90.1  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 		 810 aa  90.1  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  26.02 
 
 		 722 aa  90.1  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.88 
 
 		 759 aa  89.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  39.86 
 
 		 634 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  38.52 
 
 		 448 aa  89.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.11 
 
 		 768 aa  89  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  39.16 
 
 		 682 aa  89  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  38.1 
 
 		 450 aa  89.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  40.65 
 
 		 441 aa  89.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.55 
 
 		 804 aa  89  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  26.39 
 
 		 639 aa  89  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>