More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2183 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  78.74 
 
 		 922 aa  807    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  72.53 
 
 		 959 aa  669    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  70.36 
 
 		 1091 aa  698    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  76.13 
 
 		 1018 aa  725    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  100 
 
 		 908 aa  1810    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  80.04 
 
 		 1041 aa  817    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  67.31 
 
 		 1334 aa  775    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  65.91 
 
 		 1040 aa  664    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  69.79 
 
 		 1058 aa  673    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  70.41 
 
 		 1151 aa  731    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  77.49 
 
 		 1265 aa  764    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  71.03 
 
 		 974 aa  716    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  75.47 
 
 		 1194 aa  755    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  64.38 
 
 		 1080 aa  665    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  70.97 
 
 		 1024 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  73.28 
 
 		 952 aa  734    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  70.28 
 
 		 1048 aa  715    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  73.02 
 
 		 1244 aa  674    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  80.45 
 
 		 990 aa  798    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  63.27 
 
 		 991 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  67.12 
 
 		 1427 aa  754    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  76.6 
 
 		 1117 aa  756    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  63.27 
 
 		 987 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  75 
 
 		 1007 aa  868    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  73.81 
 
 		 1113 aa  731    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  73.8 
 
 		 1043 aa  737    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  77.16 
 
 		 702 aa  716    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  59.21 
 
 		 1093 aa  731    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  72.67 
 
 		 1070 aa  697    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  63.27 
 
 		 991 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  62.88 
 
 		 717 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  64.52 
 
 		 1123 aa  646    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  76.01 
 
 		 944 aa  758    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  64.9 
 
 		 1016 aa  633  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  62.92 
 
 		 961 aa  634  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  64.9 
 
 		 953 aa  619  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  61.49 
 
 		 1022 aa  600  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  61.02 
 
 		 1093 aa  594  1e-168  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  50.72 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  41.68 
 
 		 559 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  47.09 
 
 		 636 aa  356  8.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  45.41 
 
 		 564 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  43.84 
 
 		 562 aa  344  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  43 
 
 		 494 aa  343  5.999999999999999e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  43.1 
 
 		 492 aa  342  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  40.81 
 
 		 496 aa  333  8e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  40.81 
 
 		 496 aa  333  8e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  43.46 
 
 		 531 aa  327  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  43.69 
 
 		 411 aa  325  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  43.81 
 
 		 496 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  42.23 
 
 		 483 aa  325  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  43.45 
 
 		 497 aa  325  3e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  42.25 
 
 		 503 aa  324  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  44.88 
 
 		 571 aa  324  5e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  43.81 
 
 		 496 aa  323  8e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  43.45 
 
 		 497 aa  323  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  44.55 
 
 		 497 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  41.22 
 
 		 503 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  45.77 
 
 		 485 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  45.77 
 
 		 485 aa  318  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  42 
 
 		 491 aa  318  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  46 
 
 		 485 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  46 
 
 		 485 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  46 
 
 		 485 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  39.82 
 
 		 543 aa  315  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  45.75 
 
 		 485 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  41.53 
 
 		 495 aa  312  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  45.25 
 
 		 492 aa  312  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  42.36 
 
 		 490 aa  312  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  40.78 
 
 		 489 aa  311  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  41.02 
 
 		 489 aa  311  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  41.02 
 
 		 489 aa  311  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  40.71 
 
 		 499 aa  311  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  38.57 
 
 		 1142 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  40.3 
 
 		 483 aa  310  9e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  45.52 
 
 		 490 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  41.29 
 
 		 495 aa  310  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  39.76 
 
 		 1056 aa  310  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  39.64 
 
 		 517 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  41.69 
 
 		 492 aa  308  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  43.41 
 
 		 484 aa  308  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  44.9 
 
 		 416 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1619  RNAse E  40.87 
 
 		 968 aa  308  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000868095  normal  0.696665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  39.86 
 
 		 501 aa  308  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  40.38 
 
 		 476 aa  307  5.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  38.78 
 
 		 1132 aa  307  6e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  40.53 
 
 		 1012 aa  307  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  37.68 
 
 		 1076 aa  307  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2504  ribonuclease  38.33 
 
 		 1084 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  43.51 
 
 		 499 aa  307  8.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  39.86 
 
 		 1035 aa  306  8.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  40.63 
 
 		 1057 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02342  RNase E  39.36 
 
 		 1131 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.596666  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  39.55 
 
 		 528 aa  306  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  39.32 
 
 		 1175 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2233  ribonuclease E  39.95 
 
 		 1015 aa  306  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  39.56 
 
 		 1071 aa  306  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  44.23 
 
 		 493 aa  306  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  38.54 
 
 		 1132 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  44.53 
 
 		 474 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>