More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1192 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 		 313 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  80.39 
 
 		 313 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  78.14 
 
 		 312 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  77.02 
 
 		 318 aa  481  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  72.76 
 
 		 315 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  72.52 
 
 		 318 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  72.2 
 
 		 318 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  71.15 
 
 		 321 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  72.03 
 
 		 319 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  69.97 
 
 		 317 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  69.01 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  69.11 
 
 		 316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  69.16 
 
 		 321 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  66.56 
 
 		 318 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  65.92 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  65.92 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  65.92 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  64.44 
 
 		 319 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  64.86 
 
 		 318 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  56.19 
 
 		 312 aa  329  4e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  48.87 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  46.82 
 
 		 324 aa  258  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  47.76 
 
 		 324 aa  258  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  47.76 
 
 		 323 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  46.15 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  46.18 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  46.18 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  46.2 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  45.08 
 
 		 325 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  45.49 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  45.72 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  44.79 
 
 		 325 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  44.66 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  41.86 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  45.39 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  47.08 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  45.15 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  41.2 
 
 		 301 aa  228  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  43.56 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  45.63 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  42.67 
 
 		 341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  41.88 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  43.63 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  41.67 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  41.33 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  41.33 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  40.66 
 
 		 318 aa  206  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  43.46 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  34.52 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  38.52 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  36.73 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  34.86 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  35.69 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  35.69 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  35.56 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  35.69 
 
 		 349 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  35.37 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  35.69 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  35.34 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  34.95 
 
 		 349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  35.76 
 
 		 347 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  33.67 
 
 		 355 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  35.89 
 
 		 347 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 349 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  34.15 
 
 		 271 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  35.12 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  35.19 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  35.69 
 
 		 292 aa  150  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  36.93 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  35.69 
 
 		 292 aa  150  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  32.76 
 
 		 269 aa  149  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  35.43 
 
 		 274 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  34.98 
 
 		 296 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  34.24 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  36.73 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  34.86 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  34.88 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.96 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  35.97 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  35.84 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  34.81 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  34.11 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  37.38 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  33.67 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  32.67 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  37.08 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  34.41 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  31.76 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  34.55 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  35.81 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  37.31 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  34.78 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  35.34 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  34.04 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.78 
 
 		 302 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  35.34 
 
 		 296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  34.41 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  34.22 
 
 		 291 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>