More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0067 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 
465 aa  911  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  97.42 
 
 
465 aa  857  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  61.3 
 
 
477 aa  556  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  57.11 
 
 
474 aa  495  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  44.42 
 
 
472 aa  365  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  35.84 
 
 
403 aa  242  9e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.90493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  39.69 
 
 
524 aa  241  3e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  3.11445e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  38.92 
 
 
531 aa  232  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  35.32 
 
 
503 aa  228  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  36.99 
 
 
532 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  34.87 
 
 
533 aa  226  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  37.44 
 
 
525 aa  226  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  33.78 
 
 
461 aa  226  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  38.25 
 
 
740 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  6.74169e-05 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  33.94 
 
 
473 aa  222  1e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  34.12 
 
 
533 aa  222  1e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.56259e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  36.02 
 
 
461 aa  221  2e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  36.68 
 
 
530 aa  221  2e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  35.92 
 
 
403 aa  220  4e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.64404e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  34.84 
 
 
534 aa  220  4e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  34.08 
 
 
735 aa  220  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.14723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  35.56 
 
 
532 aa  219  7e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  37.7 
 
 
471 aa  219  8e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  35.58 
 
 
594 aa  219  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  35.58 
 
 
594 aa  219  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  35.59 
 
 
399 aa  218  3e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  37.53 
 
 
530 aa  217  3e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  35.48 
 
 
534 aa  217  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  39 
 
 
533 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  36.85 
 
 
457 aa  216  6e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  33.77 
 
 
533 aa  216  6e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  33.57 
 
 
533 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  34.52 
 
 
533 aa  216  9e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  33.73 
 
 
533 aa  215  1e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  34.69 
 
 
531 aa  214  2e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  34.3 
 
 
533 aa  215  2e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  34.79 
 
 
470 aa  214  3e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  34.79 
 
 
470 aa  214  3e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  35.03 
 
 
554 aa  214  3e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.42 
 
 
762 aa  213  4e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  34.94 
 
 
554 aa  213  5e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  34.94 
 
 
554 aa  213  5e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  36.01 
 
 
532 aa  213  6e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  36.48 
 
 
533 aa  213  6e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  35.7 
 
 
530 aa  213  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  35.53 
 
 
526 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  35.19 
 
 
464 aa  212  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  34.35 
 
 
532 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  35.53 
 
 
532 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  37.92 
 
 
512 aa  212  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  32.48 
 
 
532 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  35.06 
 
 
534 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  32.48 
 
 
532 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  42.07 
 
 
1029 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  33.96 
 
 
533 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  32.99 
 
 
532 aa  211  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  34.44 
 
 
533 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  48.94 
 
 
1001 aa  210  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  34.38 
 
 
415 aa  210  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.18015e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  47.35 
 
 
995 aa  209  6e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  31.77 
 
 
843 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  35.97 
 
 
500 aa  209  1e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  33.57 
 
 
413 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  2.93049e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  37.87 
 
 
533 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.41 
 
 
991 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1349  protein-export membrane protein SecD  32.52 
 
 
997 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.853966  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  36.08 
 
 
759 aa  207  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  1.07208e-07 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.76 
 
 
849 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.11 
 
 
853 aa  206  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  32.2 
 
 
534 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  32.05 
 
 
416 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  3.01062e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  44.88 
 
 
622 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  31.77 
 
 
534 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  34.7 
 
 
535 aa  204  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  34.7 
 
 
411 aa  202  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  5.72302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  34.31 
 
 
406 aa  202  1e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1384  preprotein translocase subunit SecD  38.01 
 
 
616 aa  202  1e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  hitchhiker  7.27457e-07 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  32.29 
 
 
554 aa  201  2e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1437  preprotein translocase subunit SecD  38.01 
 
 
616 aa  201  2e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.3441e-05  hitchhiker  0.000143717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1449  preprotein translocase subunit SecD  38.01 
 
 
616 aa  201  2e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00202636  normal  0.0146122 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  35.56 
 
 
464 aa  201  2e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  31.61 
 
 
441 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.45038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 
848 aa  200  4e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  37.22 
 
 
623 aa  200  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  36.08 
 
 
501 aa  200  5e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2482  preprotein translocase subunit SecD  37.5 
 
 
616 aa  199  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.87651e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2191  preprotein translocase subunit SecD  34.18 
 
 
616 aa  199  1e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111681  decreased coverage  0.00360319 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  33.55 
 
 
411 aa  198  1e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  35.04 
 
 
445 aa  198  2e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.9832e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1122  preprotein translocase subunit SecD  37.4 
 
 
615 aa  198  2e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.51 
 
 
995 aa  198  2e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  32.5 
 
 
554 aa  198  2e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  34.59 
 
 
793 aa  197  2e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  33.19 
 
 
474 aa  197  2e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.93 
 
 
856 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0599  protein-export membrane protein SecD  35.62 
 
 
612 aa  197  3e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2785  preprotein translocase subunit SecD  37.5 
 
 
616 aa  197  4e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000401853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2805  preprotein translocase subunit SecD  37.5 
 
 
616 aa  197  4e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000153559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1572  preprotein translocase subunit SecD  37.5 
 
 
616 aa  197  4e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.32578e-07  hitchhiker  1.5395e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2880  preprotein translocase subunit SecD  37.5 
 
 
616 aa  197  4e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.88716e-06  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>