More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1775 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  41.11 
 
 		 1005 aa  732    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  45.69 
 
 		 1014 aa  830    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  100 
 
 		 1010 aa  2024    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  37.43 
 
 		 1059 aa  557  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  37.59 
 
 		 1042 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  36.88 
 
 		 1040 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  36.88 
 
 		 1042 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  35.73 
 
 		 1031 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  25.45 
 
 		 1062 aa  220  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  24.91 
 
 		 1067 aa  210  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  23.79 
 
 		 1062 aa  201  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  24.95 
 
 		 1066 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  23.92 
 
 		 1062 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  24.12 
 
 		 1062 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  23.49 
 
 		 1062 aa  193  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  23.82 
 
 		 1062 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  23.53 
 
 		 1062 aa  188  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  23.5 
 
 		 1049 aa  187  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  24.03 
 
 		 1069 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  23.84 
 
 		 1062 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  23.97 
 
 		 1081 aa  183  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  23.5 
 
 		 1065 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  23.49 
 
 		 1060 aa  177  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.64 
 
 		 1138 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  24.19 
 
 		 1078 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  23.82 
 
 		 1071 aa  153  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  22.23 
 
 		 1084 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  29.07 
 
 		 686 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  22.62 
 
 		 1111 aa  129  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  22.61 
 
 		 1052 aa  124  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  24.58 
 
 		 1113 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  27.22 
 
 		 1097 aa  121  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  28.68 
 
 		 438 aa  110  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  32.79 
 
 		 567 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  26.35 
 
 		 1090 aa  106  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  28.42 
 
 		 1062 aa  107  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  25.71 
 
 		 426 aa  105  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  22.72 
 
 		 598 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  24.82 
 
 		 680 aa  104  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.96 
 
 		 1082 aa  104  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  26.65 
 
 		 1067 aa  101  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  26.02 
 
 		 438 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  26.79 
 
 		 485 aa  99.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  26.63 
 
 		 478 aa  100  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  28.64 
 
 		 702 aa  99.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.5 
 
 		 430 aa  99  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  26.46 
 
 		 484 aa  99  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  29.93 
 
 		 572 aa  98.6  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  27.14 
 
 		 445 aa  97.8  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  25.88 
 
 		 1084 aa  97.8  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  24.83 
 
 		 459 aa  97.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  23.94 
 
 		 426 aa  96.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  32.83 
 
 		 430 aa  95.9  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  26.28 
 
 		 692 aa  95.9  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  32.32 
 
 		 430 aa  95.5  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  26.67 
 
 		 455 aa  95.1  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  28.51 
 
 		 969 aa  94.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  25.74 
 
 		 1125 aa  94  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.19 
 
 		 432 aa  93.6  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  32.32 
 
 		 430 aa  93.2  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  22.46 
 
 		 672 aa  92  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  24.67 
 
 		 423 aa  92  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  26.01 
 
 		 433 aa  92  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  26.4 
 
 		 511 aa  90.5  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  26.23 
 
 		 694 aa  89.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  26.6 
 
 		 666 aa  89  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  22.22 
 
 		 437 aa  87.8  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  31.79 
 
 		 446 aa  87.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  25.35 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  23.61 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  24.83 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  32.02 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  22.6 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  23.62 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  26.44 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  22.44 
 
 		 434 aa  84.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  21.94 
 
 		 407 aa  83.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  24.68 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  26.72 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  31.86 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  29.44 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  29.44 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  24.33 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  29.44 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.47 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2041  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  31.55 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.73 
 
 		 717 aa  82  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  34.08 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  29.44 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  29.44 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  29.44 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  29.63 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  29.44 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  23.78 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  30.81 
 
 		 463 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  23.39 
 
 		 409 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  36.97 
 
 		 440 aa  80.1  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  36.97 
 
 		 437 aa  80.1  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  30.57 
 
 		 421 aa  79.7  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30 
 
 		 407 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>