180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2581 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 197 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  86.8 
 
 		 197 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  54.87 
 
 		 197 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  55.38 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  49.48 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  50.58 
 
 		 279 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 192 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  49.47 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  46.49 
 
 		 200 aa  134  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  44.56 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  38.22 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  45.54 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  27.57 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 239 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  40.86 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.74 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 255 aa  48.9  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  40.35 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1896  hypothetical protein  29.23 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.558893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3462  hypothetical protein  29.23 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  34.85 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>