More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0102 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  78.87 
 
 		 215 aa  358  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  72.9 
 
 		 215 aa  333  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  74.29 
 
 		 215 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  74.29 
 
 		 215 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  74.29 
 
 		 215 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  72.9 
 
 		 215 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  72.9 
 
 		 215 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  73.81 
 
 		 215 aa  329  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  72.43 
 
 		 215 aa  328  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  72.43 
 
 		 215 aa  328  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  69.67 
 
 		 220 aa  316  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  69.34 
 
 		 225 aa  315  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  69.38 
 
 		 213 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  66.51 
 
 		 217 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  66.19 
 
 		 215 aa  287  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  66.18 
 
 		 211 aa  286  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  45.5 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 242 aa  194  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  45.83 
 
 		 211 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  36.65 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  36 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  34.17 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
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NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 223 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 253 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  33.54 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 220 aa  104  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  28.16 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  35.29 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
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NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  38.33 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  34.21 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
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NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
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NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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