More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0090 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  75 
 
 		 252 aa  371  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  66.39 
 
 		 245 aa  308  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  64.58 
 
 		 269 aa  304  7e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  64.02 
 
 		 279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  63.29 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  62.82 
 
 		 262 aa  298  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  61.86 
 
 		 244 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  61.04 
 
 		 264 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  64.07 
 
 		 256 aa  292  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  58.33 
 
 		 455 aa  288  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.5 
 
 		 280 aa  286  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  60.35 
 
 		 445 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  61.28 
 
 		 253 aa  281  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  57.32 
 
 		 277 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  59.05 
 
 		 258 aa  278  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  57.08 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  58.82 
 
 		 266 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  54.92 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  56.84 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  63.44 
 
 		 257 aa  270  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  56.6 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  59.83 
 
 		 253 aa  269  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 256 aa  268  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  61.51 
 
 		 241 aa  267  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  60.17 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  61.7 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  58.65 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  57.39 
 
 		 250 aa  265  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  55.56 
 
 		 255 aa  264  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.3 
 
 		 264 aa  264  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  57.81 
 
 		 258 aa  264  8.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  55.13 
 
 		 255 aa  263  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  56.14 
 
 		 291 aa  261  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  60.17 
 
 		 258 aa  261  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  61.09 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  60.53 
 
 		 312 aa  258  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.05 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  59.64 
 
 		 268 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  57.85 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  54.78 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  60.85 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  54.78 
 
 		 255 aa  254  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  52.86 
 
 		 263 aa  254  6e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  56.83 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  54.89 
 
 		 252 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  57.08 
 
 		 257 aa  251  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  53.56 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  61.11 
 
 		 224 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  60.26 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  55.7 
 
 		 288 aa  248  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  54.22 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  63.29 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 		 279 aa  247  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  53.1 
 
 		 258 aa  245  6e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.25 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  53.57 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  54.55 
 
 		 293 aa  239  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  57.46 
 
 		 255 aa  239  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  57.92 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  57.45 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.35 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  53.19 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.45 
 
 		 228 aa  224  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  56.49 
 
 		 249 aa  224  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  53.71 
 
 		 235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  45.91 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  45.22 
 
 		 255 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  53.16 
 
 		 247 aa  211  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  46.79 
 
 		 225 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  52.53 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 232 aa  208  7e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  46.08 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.2 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.91 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.57 
 
 		 237 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  49.32 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  45.25 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  44.04 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  49.77 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  45.25 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.2 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  39.5 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  41.18 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  44.09 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  42.66 
 
 		 227 aa  202  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  45.27 
 
 		 653 aa  201  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  42.92 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  44.35 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0180  ABC transporter related  50.23 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585319 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  38.81 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  44.64 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>