More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2423 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 341 aa  672    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  63.41 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  66.78 
 
 		 342 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  55.84 
 
 		 317 aa  334  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  57.68 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  55.56 
 
 		 317 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  53.04 
 
 		 321 aa  315  8e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  55.1 
 
 		 314 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  53.27 
 
 		 307 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 		 289 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  52.04 
 
 		 312 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  52.54 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  50.99 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  56.86 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  54.79 
 
 		 304 aa  295  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  50.16 
 
 		 313 aa  292  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  51.51 
 
 		 308 aa  288  6e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  51.67 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  47.38 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  52.9 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  53.59 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  54.08 
 
 		 293 aa  276  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  54.92 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  50.33 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  51.75 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  51.75 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  51.75 
 
 		 310 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  51.39 
 
 		 313 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  53.42 
 
 		 294 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  52.63 
 
 		 313 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  48.98 
 
 		 342 aa  262  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  50.66 
 
 		 339 aa  261  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  44.55 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  52.41 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  48.32 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  47.64 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  45.25 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  45.25 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  43.19 
 
 		 323 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  43.19 
 
 		 323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  42.9 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  49.82 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  42.95 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  43.29 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  43.79 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  41.72 
 
 		 535 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  44.37 
 
 		 534 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 622 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  43.08 
 
 		 624 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  42.44 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  42.81 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  40.97 
 
 		 312 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  43.31 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  39.62 
 
 		 316 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  40.2 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  36.95 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  41.61 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  40.2 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  37.67 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  37.67 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  42.72 
 
 		 443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  39.49 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 		 310 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  39.53 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  41.41 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  41.41 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  46.4 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  38.83 
 
 		 303 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  39.53 
 
 		 483 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  38.28 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 478 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  43.06 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  40.43 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  40.43 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  38.73 
 
 		 315 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  40.97 
 
 		 304 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  40.97 
 
 		 304 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  42.41 
 
 		 297 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  38.11 
 
 		 315 aa  175  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  37.91 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  39.68 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  40.43 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  40.43 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  37.2 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  37.94 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  40.65 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  37.62 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  41.88 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  35.89 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  39.18 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  38.31 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  45.07 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>