More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0425 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  84.7 
 
 		 196 aa  309  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  84.7 
 
 		 201 aa  308  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  78.12 
 
 		 195 aa  302  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  77.49 
 
 		 195 aa  293  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  71.73 
 
 		 201 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  71.73 
 
 		 201 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  56.04 
 
 		 199 aa  201  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  59.07 
 
 		 196 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  58.03 
 
 		 196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 197 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 197 aa  177  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  47.15 
 
 		 199 aa  175  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 197 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  48.96 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 198 aa  98.2  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 225 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  35.67 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  37.29 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  48.44 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.93 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  36.7 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  29.34 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  52.31 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.9 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  43.55 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.55 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.55 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.55 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.55 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.55 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.55 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  43.55 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  32.62 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 310 aa  61.2  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>