91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4360 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 429 aa  860    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  41.01 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 		 424 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 419 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  28.97 
 
 		 415 aa  192  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  31.17 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  24.69 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  24.44 
 
 		 422 aa  143  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  24.44 
 
 		 422 aa  143  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  24.44 
 
 		 422 aa  143  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  24.19 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  24.19 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  24.19 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  24.19 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  25.66 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  25.66 
 
 		 421 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  26.2 
 
 		 416 aa  137  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  24.49 
 
 		 422 aa  134  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 412 aa  126  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  27.13 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  24.55 
 
 		 475 aa  113  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  23.53 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 433 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  22.28 
 
 		 481 aa  99.8  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 486 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 416 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 485 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  22.14 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 474 aa  91.3  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  23.53 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  24.06 
 
 		 472 aa  87.4  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  22.6 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  22.3 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  25.14 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  21.29 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  21.68 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  21.41 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  21.66 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 438 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  18.42 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  23.65 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  19.25 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  22.97 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  22.97 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  21.02 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 435 aa  53.1  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 451 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 		 502 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  29.82 
 
 		 430 aa  50.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 490 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 		 479 aa  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  21.7 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  20.95 
 
 		 477 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 517 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 529 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 526 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  19.8 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  20.79 
 
 		 511 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>