138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3502 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 278 aa  578  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  37.09 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  22.75 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  26.86 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  23.98 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  29.47 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  28.49 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  22.99 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.73 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  24.73 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  24.73 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  24.69 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  24.3 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  25.86 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.75 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.37 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  23.4 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  25.09 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  25.39 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  23.35 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.09 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  22.02 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  23.5 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  25.76 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  20.71 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0651  transcriptional regulator, AraC family  24.27 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  21.93 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  25.95 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  24.56 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  24.81 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 309 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  22.35 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  23.04 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  24.44 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  26.97 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  23.62 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  25.67 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  21.51 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  22.37 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  22.14 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4438  helix-turn-helix domain-containing protein  22.93 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  22.94 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  21.5 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.76 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  25.99 
 
 		 229 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  24.72 
 
 		 327 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  24.75 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  26.35 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.72 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  22.84 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2143  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.88 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.29 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  21.53 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  23.24 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.47 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  20.3 
 
 		 271 aa  48.9  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 275 aa  48.9  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  20.67 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  20.55 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.1 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 333 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>