210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1493 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 		 317 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  38.05 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  46.07 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  35.77 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  30.41 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  31.07 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  31.58 
 
 		 335 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.95 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  41.27 
 
 		 405 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  38.46 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  33.92 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.44 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  37.22 
 
 		 392 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.45 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.7 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  28.68 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  30.41 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  30.15 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.62 
 
 		 370 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  31.02 
 
 		 471 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  31.44 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 341 aa  106  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  30.64 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.78 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  27.43 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  30.77 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  36.31 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  28.47 
 
 		 795 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.49 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.34 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  37.22 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  30.27 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.39 
 
 		 451 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.86 
 
 		 344 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  31.88 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  34.87 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  34.91 
 
 		 1002 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.15 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.24 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  30.1 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  29.89 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.37 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  25.09 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  24.82 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.3 
 
 		 429 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  28.33 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  25.75 
 
 		 486 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  26.07 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.06 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.94 
 
 		 659 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  22.07 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  25.99 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  24.51 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  26.37 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  27.3 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  27.3 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  27.3 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  25.48 
 
 		 410 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  30.5 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  26.1 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  33.09 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  26.02 
 
 		 398 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  25.59 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  27.62 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  27.62 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  27.62 
 
 		 382 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  27.62 
 
 		 382 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  27.62 
 
 		 382 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  27.62 
 
 		 382 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  26.33 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  29.94 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  22.8 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  27.62 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  30.5 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.75 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  26.19 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  26.03 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  24.48 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  26.67 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.34 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  32.5 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  26.44 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  24.06 
 
 		 406 aa  62.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  28.87 
 
 		 544 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  33.33 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  31.3 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  30 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  28.86 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  27.97 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  26.63 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  23.19 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  25.24 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  30.82 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  30.4 
 
 		 423 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  22.9 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  30.14 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  28.25 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  28.65 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>