More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32590 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  100 
 
 		 215 aa  423  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  67.16 
 
 		 281 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  66.18 
 
 		 224 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  62.62 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  54.19 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  57.35 
 
 		 206 aa  218  5e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  58.88 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  53.08 
 
 		 901 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  54.5 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  53.61 
 
 		 234 aa  201  5e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  53.11 
 
 		 703 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  52.34 
 
 		 662 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  54.29 
 
 		 705 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  56.38 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  48.6 
 
 		 686 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  51.43 
 
 		 707 aa  187  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  49.24 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 671 aa  184  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  52.53 
 
 		 688 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  47.66 
 
 		 688 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  50.99 
 
 		 202 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  50.71 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  46.8 
 
 		 205 aa  168  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  47.5 
 
 		 686 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  48.82 
 
 		 707 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  43.54 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  43.14 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  45.32 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  47.8 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  41.15 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  44.83 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  39.8 
 
 		 204 aa  161  7e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  44.06 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  44.06 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  44.06 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  44.06 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  44.06 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  43.56 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  47.31 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  44.55 
 
 		 244 aa  154  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.06 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  39.13 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  45.88 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  38.92 
 
 		 203 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  38.83 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  43.3 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.49 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  41.5 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  43.56 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  48.45 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  46.31 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  38.65 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  42.51 
 
 		 221 aa  147  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  44.24 
 
 		 730 aa  147  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  38.46 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  42.64 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 295 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  41.59 
 
 		 236 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  42.4 
 
 		 224 aa  144  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.43 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  44.33 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  39.91 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  40.38 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  42.23 
 
 		 209 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  38.46 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  40.65 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  40.48 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  41.47 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  39.51 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  43.96 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  41.47 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  40.31 
 
 		 197 aa  142  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  39.81 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  41.18 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>