114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  100 
 
 		 643 aa  1243    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  32.68 
 
 		 760 aa  127  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  33.48 
 
 		 766 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  31.25 
 
 		 760 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  31.67 
 
 		 772 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  31.25 
 
 		 542 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  31.25 
 
 		 765 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  31.25 
 
 		 779 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  24.81 
 
 		 1112 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  24.81 
 
 		 1070 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  24.81 
 
 		 1070 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  31.51 
 
 		 347 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  32.51 
 
 		 766 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  36.08 
 
 		 1085 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  27.73 
 
 		 995 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  31.84 
 
 		 755 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  36.69 
 
 		 341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  33.88 
 
 		 1266 aa  114  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  33.03 
 
 		 531 aa  110  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.62 
 
 		 1351 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  28.94 
 
 		 772 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  28.44 
 
 		 1088 aa  104  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.92 
 
 		 348 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.92 
 
 		 348 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  24.48 
 
 		 1012 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  24.14 
 
 		 994 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  28.33 
 
 		 789 aa  99.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  28.33 
 
 		 789 aa  99.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  24.44 
 
 		 954 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1052 aa  97.4  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  27.8 
 
 		 858 aa  97.1  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  24.51 
 
 		 993 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  24.89 
 
 		 1011 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  26.24 
 
 		 284 aa  85.9  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  26.41 
 
 		 565 aa  84  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  25.73 
 
 		 877 aa  81.3  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  30.32 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  28.15 
 
 		 355 aa  80.1  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.15 
 
 		 1107 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  30.97 
 
 		 587 aa  79  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  25.41 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  24.77 
 
 		 539 aa  72.8  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  27.72 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  27.03 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  25.42 
 
 		 692 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  26.42 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  35.58 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.89 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  25.25 
 
 		 384 aa  66.6  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  27.16 
 
 		 400 aa  67  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  22.27 
 
 		 718 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  26.26 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  42.99 
 
 		 1744 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  27.96 
 
 		 1335 aa  65.1  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  25.48 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  29.11 
 
 		 637 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  29.32 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1231 aa  63.9  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  32.5 
 
 		 886 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  27.66 
 
 		 892 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2618  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0431913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  36.48 
 
 		 1086 aa  63.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  62  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.31 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  27.18 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  27.42 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  23.08 
 
 		 400 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  25.24 
 
 		 344 aa  60.1  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  26.82 
 
 		 935 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.12 
 
 		 1263 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  34.16 
 
 		 867 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  26.37 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  29.78 
 
 		 863 aa  57.4  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  27.84 
 
 		 816 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  30.18 
 
 		 1344 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  29.83 
 
 		 312 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  40.65 
 
 		 937 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  24.5 
 
 		 2132 aa  54.7  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  28.28 
 
 		 765 aa  54.7  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  25.96 
 
 		 528 aa  54.3  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  37.06 
 
 		 937 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  27.04 
 
 		 374 aa  53.5  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.44 
 
 		 1015 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  26.97 
 
 		 242 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  30.17 
 
 		 413 aa  52  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  29.18 
 
 		 522 aa  52  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  30.65 
 
 		 1780 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52710  predicted protein  37.36 
 
 		 682 aa  51.2  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.120093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  32.99 
 
 		 761 aa  50.4  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  26.7 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  32.51 
 
 		 416 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  27.67 
 
 		 1041 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  26.72 
 
 		 1290 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  29.17 
 
 		 205 aa  48.9  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 437 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  26.91 
 
 		 586 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  24.32 
 
 		 535 aa  48.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 		 450 aa  47.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  33.04 
 
 		 448 aa  47.4  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  27.41 
 
 		 291 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>