More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2220 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  100 
 
 		 565 aa  1165    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  56.17 
 
 		 577 aa  648    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  55.71 
 
 		 577 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  55.71 
 
 		 577 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  90.28 
 
 		 567 aa  1060    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  90.28 
 
 		 567 aa  1060    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2119  response regulator  51.83 
 
 		 565 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2110  stage II sporulation E family protein  55.41 
 
 		 369 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3297  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 550 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2108  response regulator receiver protein  59.28 
 
 		 224 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  28.27 
 
 		 577 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  27.4 
 
 		 564 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  26.66 
 
 		 548 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  26.63 
 
 		 562 aa  207  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  26.99 
 
 		 564 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  27.38 
 
 		 567 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  26.87 
 
 		 563 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  27.68 
 
 		 563 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  26.25 
 
 		 568 aa  199  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  25.77 
 
 		 575 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  26.99 
 
 		 568 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  26.5 
 
 		 563 aa  196  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  27.21 
 
 		 568 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  25.66 
 
 		 571 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  26.98 
 
 		 575 aa  194  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  25.57 
 
 		 571 aa  193  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  24.87 
 
 		 574 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  28.52 
 
 		 572 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  26 
 
 		 568 aa  183  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  25.13 
 
 		 561 aa  151  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  23 
 
 		 567 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  26.48 
 
 		 393 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  28.61 
 
 		 390 aa  121  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0106  stage II sporulation E  30.65 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  26.58 
 
 		 373 aa  120  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  27.07 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  24.09 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  24.78 
 
 		 378 aa  103  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  26.79 
 
 		 513 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  25.9 
 
 		 367 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  27.34 
 
 		 504 aa  87  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.18 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.72 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  22.01 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.01 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.01 
 
 		 486 aa  80.1  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  22.59 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  27.15 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  24.4 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  24.93 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  26.91 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  26.94 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  24.57 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  24.57 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1482  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.62 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.712271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.7 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  27.38 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1312  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000399806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1379  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00673289  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3386  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0559  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1136  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.29 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3376  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2148  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181807 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.33 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1649  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3238  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.19 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.963577  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0123  DNA-binding response regulator  31.15 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  20.38 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 1143 aa  73.6  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2146  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1461  response regulator receiver  29.94 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000661728  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 544 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 391 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 		 357 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4259  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 504 aa  73.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  28.14 
 
 		 394 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  28.1 
 
 		 222 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.17 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3962  two-component response regulator PfeR  30.61 
 
 		 240 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2539  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.846517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1934  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808753  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01515  rteB, two-component system response regulator  27.32 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0452402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0568  two component transcriptional regulator  34.04 
 
 		 230 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  35.92 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  28.81 
 
 		 270 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  35.4 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  25.81 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  26.01 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0579  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0534  winged helix family two component transcriptional regulator  34.04 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1554  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.85 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.37 
 
 		 739 aa  70.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.498595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.82 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>