More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3386 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3386  response regulator receiver protein  100 
 
 		 156 aa  313  5e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2146  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.39 
 
 		 228 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1241  two component transcriptional regulator  48.33 
 
 		 220 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0559  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 228 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276329  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  42.96 
 
 		 253 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  42.96 
 
 		 253 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.193178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 243 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5423  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 239 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04992  positive response regulator for pho regulon  43.97 
 
 		 256 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 242 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  46.55 
 
 		 235 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  46.55 
 
 		 235 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  46.55 
 
 		 235 aa  98.2  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  46.55 
 
 		 235 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  46.55 
 
 		 235 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  46.55 
 
 		 235 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  46.55 
 
 		 235 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 226 aa  98.2  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001205  DNA-binding response regulator  41.09 
 
 		 243 aa  97.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.83 
 
 		 244 aa  97.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  46.55 
 
 		 235 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 235 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 235 aa  97.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  46.55 
 
 		 235 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  45.69 
 
 		 237 aa  97.1  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  44.92 
 
 		 229 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 237 aa  96.7  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  43.1 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  44.92 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  44.92 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  44.92 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 220 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  44.92 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  44.92 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  44.92 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  44.92 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0253  DNA-binding response regulator PhoB  46.61 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  44.92 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  44.92 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 229 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 220 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 226 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 220 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3569  DNA-binding response regulator CreB  43.97 
 
 		 237 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01026  response regulator  45.76 
 
 		 229 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4798  DNA-binding response regulator CreB  43.97 
 
 		 237 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5485  DNA-binding response regulator CreB  43.97 
 
 		 237 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.631221 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.86 
 
 		 226 aa  94  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1483  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 225 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0288957  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 		 235 aa  94.4  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 230 aa  94  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  44.07 
 
 		 229 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  44.92 
 
 		 229 aa  94  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  43.1 
 
 		 236 aa  93.6  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0496  transcriptional regulator PhoB  44.07 
 
 		 229 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  44.07 
 
 		 229 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0441  transcriptional regulator PhoB  44.07 
 
 		 229 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  44.07 
 
 		 229 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  44.92 
 
 		 229 aa  94  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23930  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.88 
 
 		 226 aa  93.6  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00212671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 227 aa  93.6  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  39.23 
 
 		 236 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004385  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  44.92 
 
 		 229 aa  93.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 231 aa  93.6  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 232 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0531  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 229 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 226 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  37.6 
 
 		 227 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 238 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 232 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3106  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  44.92 
 
 		 229 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1861  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 225 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0416  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 239 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 235 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 236 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  34.65 
 
 		 222 aa  92.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  41.46 
 
 		 233 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 232 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  43.7 
 
 		 230 aa  92.8  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 250 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  40.52 
 
 		 234 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 224 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 237 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 222 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 248 aa  92  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  43.22 
 
 		 230 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 232 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  38.24 
 
 		 226 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 234 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 232 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  44.35 
 
 		 235 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 232 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 228 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 232 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  39.84 
 
 		 240 aa  92.8  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  41.46 
 
 		 233 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  41.46 
 
 		 233 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.69 
 
 		 223 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  92  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>