More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0416 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0416  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  495  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1261  DNA-binding response regulator  61.28 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  44.12 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 223 aa  191  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  42.74 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3085  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000315463  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 240 aa  177  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.13 
 
 		 244 aa  177  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  42.26 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1099  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  41.91 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  41.7 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  41.42 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  41.42 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  41.42 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  41.42 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  41.42 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  41.42 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  41.67 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  41.67 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.91 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 233 aa  175  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  41.84 
 
 		 239 aa  175  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  42.31 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0402  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.88 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.8 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  43.1 
 
 		 235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  40.76 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.06 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.06 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1007  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.31 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  41.42 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  42.26 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.45 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  40.59 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  38.24 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.193178 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1408  two component transcriptional regulator  38.56 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  38.72 
 
 		 230 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 235 aa  168  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.24 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 		 241 aa  168  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.95 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  41.95 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 242 aa  168  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  40.33 
 
 		 237 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  42.67 
 
 		 225 aa  168  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 226 aa  168  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 225 aa  167  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  38.56 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  43.22 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  43.22 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  38.03 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  39.15 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  39.15 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>