86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0790 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0790  porin  100 
 
 		 354 aa  712    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  98.87 
 
 		 354 aa  705    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  98.31 
 
 		 354 aa  704    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  99.15 
 
 		 354 aa  708    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  82.49 
 
 		 354 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  82.2 
 
 		 354 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  82.2 
 
 		 354 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  74.65 
 
 		 354 aa  542  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  72.03 
 
 		 352 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  70.34 
 
 		 354 aa  520  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  65.83 
 
 		 355 aa  481  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  56.58 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  57.06 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  56.15 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  56.08 
 
 		 348 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  54.64 
 
 		 353 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  54.08 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  55.25 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  53.8 
 
 		 353 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  53.03 
 
 		 369 aa  360  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  51.87 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  54.14 
 
 		 347 aa  352  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  53.26 
 
 		 354 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  53.26 
 
 		 354 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  52.41 
 
 		 365 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  52.85 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  52.03 
 
 		 359 aa  345  8e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  49.85 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  47.14 
 
 		 347 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  47.14 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  46.22 
 
 		 351 aa  295  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2092  porin  40.58 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.078027  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  39.04 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  38.29 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  36.94 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0811  outer membrane porin, putative  33.82 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  36.92 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  28.53 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  29.37 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  27.96 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  28.29 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  31.65 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  31.29 
 
 		 314 aa  119  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  31.29 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  30.46 
 
 		 314 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  30.46 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  27.92 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  30.13 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  30.13 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  26.89 
 
 		 316 aa  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  29.39 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  30.57 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  27.27 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  26.86 
 
 		 315 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  27.71 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  26.46 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  27.71 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  27.61 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  28.47 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  32.91 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  23.68 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  26.24 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  21.97 
 
 		 366 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1877  porin  31.46 
 
 		 361 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000050808  unclonable  0.0000817359 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  22.57 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1642  porin  29.5 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000869717  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  24.22 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  25 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  27.01 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  26.19 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  26.78 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  30.6 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  24.18 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  23.98 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  24.58 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4118  porin Gram-negative type  23.89 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  23.55 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  23.91 
 
 		 358 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  24.75 
 
 		 326 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  23.91 
 
 		 358 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  23.91 
 
 		 358 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  25.07 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0545  OmpC family outer membrane porin  22.93 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  25.07 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  25.07 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  22.84 
 
 		 360 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>