More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0492 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  100 
 
 		 462 aa  936    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  59.49 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  58.67 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  58.93 
 
 		 438 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  54.87 
 
 		 439 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  58.93 
 
 		 438 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  58.42 
 
 		 437 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  58.16 
 
 		 439 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  57.61 
 
 		 438 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  56.46 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  55.61 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  56.23 
 
 		 436 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  54.8 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  56.23 
 
 		 436 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  54.46 
 
 		 468 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  53 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  53.2 
 
 		 439 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  54.57 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  49.31 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  48 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  49.41 
 
 		 440 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  51.91 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  50.8 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  48.96 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  48.96 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  47.73 
 
 		 480 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  48.66 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  47.45 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  47.6 
 
 		 481 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  53.93 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  47.87 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  47.23 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  54.7 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  46.56 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  47.76 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  54.83 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  46.94 
 
 		 452 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  50.51 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  48.74 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  49.51 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  50.63 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  52.26 
 
 		 482 aa  365  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  52.26 
 
 		 482 aa  365  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  50.38 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  50.13 
 
 		 456 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  47.69 
 
 		 445 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  45.71 
 
 		 444 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  46.88 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  46.88 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  48.79 
 
 		 448 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  48.54 
 
 		 448 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  46.47 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  50.13 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  47.99 
 
 		 422 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  48.77 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  45.37 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  46.77 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  45.71 
 
 		 444 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  46.08 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  48.98 
 
 		 440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  46.42 
 
 		 440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  47.71 
 
 		 445 aa  356  5.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  47.5 
 
 		 442 aa  355  7.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  50.64 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  43.28 
 
 		 444 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  50.64 
 
 		 424 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  50.77 
 
 		 440 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  46.47 
 
 		 457 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  50.13 
 
 		 440 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  50.13 
 
 		 440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  44.99 
 
 		 477 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  42.49 
 
 		 438 aa  352  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  44.76 
 
 		 461 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  47.59 
 
 		 434 aa  348  8e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  45.69 
 
 		 530 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  49.74 
 
 		 444 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  47.58 
 
 		 449 aa  346  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  47.24 
 
 		 444 aa  345  8e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  47.81 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  47.29 
 
 		 515 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  41.07 
 
 		 478 aa  342  7e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  44.77 
 
 		 415 aa  342  8e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  45.36 
 
 		 480 aa  342  8e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  48.39 
 
 		 515 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  44.91 
 
 		 522 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  46.29 
 
 		 477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  45.73 
 
 		 526 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  43.71 
 
 		 456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  43.71 
 
 		 456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  41.03 
 
 		 478 aa  340  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  42.29 
 
 		 479 aa  340  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  40.81 
 
 		 478 aa  339  7e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  44.05 
 
 		 521 aa  339  7e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  43.81 
 
 		 524 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  43.81 
 
 		 530 aa  339  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  43.81 
 
 		 524 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  43.81 
 
 		 524 aa  339  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  43.81 
 
 		 530 aa  339  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>