More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5078 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
979 aa  1971  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  84.53 
 
 
975 aa  1225  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.6 
 
 
725 aa  385  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5918  glycosyl transferase family 51  35.17 
 
 
927 aa  364  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
806 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
806 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
806 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  37.28 
 
 
821 aa  359  2e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  36.12 
 
 
815 aa  345  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  37.32 
 
 
830 aa  338  3e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
1245 aa  317  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
695 aa  311  3e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 
950 aa  302  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.67 
 
 
814 aa  300  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 
764 aa  298  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  35 
 
 
836 aa  294  6e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 
769 aa  292  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 
1065 aa  289  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  33.76 
 
 
838 aa  289  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.22 
 
 
890 aa  286  1e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2691  glycosyl transferase family 51  36.33 
 
 
711 aa  283  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0728241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.42 
 
 
1129 aa  280  8e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  32.34 
 
 
727 aa  276  1e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
778 aa  273  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.76 
 
 
859 aa  272  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  32.69 
 
 
719 aa  272  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  31.84 
 
 
724 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  33.28 
 
 
1117 aa  268  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  32.72 
 
 
822 aa  264  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  33.38 
 
 
825 aa  257  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.98 
 
 
761 aa  256  1e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  32.17 
 
 
764 aa  256  2e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  32.02 
 
 
808 aa  252  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  31.01 
 
 
867 aa  248  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  30.69 
 
 
774 aa  246  1e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  30.76 
 
 
761 aa  246  1e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 
747 aa  242  3e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  31.61 
 
 
817 aa  239  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  29.01 
 
 
880 aa  238  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  31.33 
 
 
1306 aa  236  1e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  29.49 
 
 
784 aa  235  4e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  29.64 
 
 
978 aa  232  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
819 aa  230  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  29.78 
 
 
765 aa  229  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 
766 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  33.28 
 
 
722 aa  228  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  30.59 
 
 
648 aa  228  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  30.33 
 
 
712 aa  228  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  29.48 
 
 
961 aa  227  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  29.68 
 
 
649 aa  227  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  30.35 
 
 
723 aa  225  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  30.08 
 
 
905 aa  224  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  30.79 
 
 
750 aa  222  2e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.38 
 
 
643 aa  222  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.38 
 
 
643 aa  222  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
758 aa  221  4e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  29.37 
 
 
801 aa  220  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
710 aa  219  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
758 aa  218  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  30.35 
 
 
661 aa  217  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
871 aa  217  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  30.68 
 
 
752 aa  217  1e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  30.77 
 
 
803 aa  215  4e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  30.07 
 
 
726 aa  215  4e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.53 
 
 
763 aa  214  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
710 aa  213  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  30.64 
 
 
704 aa  213  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  28.22 
 
 
720 aa  212  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  29.9 
 
 
773 aa  210  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  29.02 
 
 
811 aa  210  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  30.04 
 
 
618 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  29.17 
 
 
683 aa  209  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  30.28 
 
 
710 aa  209  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  29.31 
 
 
643 aa  208  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  30.14 
 
 
721 aa  207  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  28.44 
 
 
779 aa  207  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  30.02 
 
 
662 aa  207  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  29.52 
 
 
680 aa  207  8e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  29.6 
 
 
681 aa  207  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  28.16 
 
 
668 aa  207  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  29.72 
 
 
712 aa  206  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  29.19 
 
 
714 aa  205  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  29.76 
 
 
776 aa  205  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  27.93 
 
 
683 aa  204  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  27.93 
 
 
683 aa  204  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
820 aa  204  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  29.45 
 
 
739 aa  204  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  26.74 
 
 
683 aa  204  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  30.17 
 
 
626 aa  204  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  27.44 
 
 
683 aa  202  2e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
877 aa  202  2e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  29 
 
 
648 aa  202  2e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  28.44 
 
 
680 aa  202  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  27.63 
 
 
683 aa  201  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  27.51 
 
 
683 aa  201  8e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  27.42 
 
 
683 aa  200  1e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  27.36 
 
 
683 aa  200  1e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  29.22 
 
 
734 aa  200  1e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  29.98 
 
 
658 aa  200  1e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  26.55 
 
 
776 aa  199  2e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>