179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3967 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  89.04 
 
 		 447 aa  830    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 448 aa  915    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  66.96 
 
 		 451 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  60.58 
 
 		 448 aa  559  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  58.31 
 
 		 457 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  51.7 
 
 		 448 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  53.59 
 
 		 462 aa  465  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  53.56 
 
 		 464 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  52.2 
 
 		 498 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  49.34 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  49.19 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  48.51 
 
 		 482 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  42.82 
 
 		 485 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  37.97 
 
 		 453 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  37.47 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  36.97 
 
 		 451 aa  274  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  35.33 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  37.26 
 
 		 449 aa  269  8e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 		 452 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  36.83 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  36.95 
 
 		 432 aa  263  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  37.07 
 
 		 450 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  37.18 
 
 		 452 aa  256  8e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  35.85 
 
 		 544 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  36.39 
 
 		 449 aa  253  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  34.79 
 
 		 452 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  35.84 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.99 
 
 		 448 aa  237  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  34.67 
 
 		 440 aa  237  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  32.68 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  31.33 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  30.91 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  31.46 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 404 aa  116  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 447 aa  106  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.95 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 434 aa  67  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  28.28 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  22.06 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  22.94 
 
 		 434 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.53 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 441 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  20.16 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.09 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  19.05 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  23 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  20.31 
 
 		 451 aa  53.1  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  24.43 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 427 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  30.97 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.7 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1342  5'-Nucleotidase domain protein  27.48 
 
 		 618 aa  51.2  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.206839  normal  0.550173 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.64 
 
 		 438 aa  50.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  22.27 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>