175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4662 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  767    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  76.62 
 
 		 386 aa  511  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  64.23 
 
 		 259 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  65.32 
 
 		 253 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  67.34 
 
 		 253 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  63.67 
 
 		 248 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  64.37 
 
 		 247 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  64.37 
 
 		 247 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  64.49 
 
 		 257 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  64.49 
 
 		 257 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  64.08 
 
 		 257 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  64.08 
 
 		 257 aa  291  9e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  63.96 
 
 		 268 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  65 
 
 		 252 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  65 
 
 		 252 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  64.32 
 
 		 252 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  64.32 
 
 		 252 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  64.32 
 
 		 252 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  64.32 
 
 		 252 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  62.75 
 
 		 247 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  63.16 
 
 		 247 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  53.25 
 
 		 253 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  59.41 
 
 		 270 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  49.05 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  55.31 
 
 		 265 aa  222  9e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  55.31 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  53.81 
 
 		 256 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  58.06 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  57.25 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  49.59 
 
 		 260 aa  209  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  55.24 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  65.55 
 
 		 126 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  69.9 
 
 		 114 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  62.86 
 
 		 133 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  38.14 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  61.32 
 
 		 130 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  49.14 
 
 		 142 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  40.85 
 
 		 232 aa  123  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  59.26 
 
 		 125 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  54.46 
 
 		 129 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  51.61 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  52.8 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  53.45 
 
 		 132 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  41.12 
 
 		 235 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  35.04 
 
 		 283 aa  113  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  58.1 
 
 		 124 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  58.49 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  49.06 
 
 		 124 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  50.93 
 
 		 118 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  55.79 
 
 		 137 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  46.36 
 
 		 132 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  46.09 
 
 		 131 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  49.56 
 
 		 130 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  44.17 
 
 		 130 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  44.06 
 
 		 154 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  40.32 
 
 		 250 aa  97.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  41.76 
 
 		 244 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  41.51 
 
 		 127 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  45.16 
 
 		 111 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  58.24 
 
 		 124 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  47.27 
 
 		 133 aa  92  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  64.06 
 
 		 75 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  55.96 
 
 		 125 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  40.35 
 
 		 121 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  32.99 
 
 		 242 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  55.56 
 
 		 131 aa  87  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  38.89 
 
 		 127 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  55.96 
 
 		 120 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  43.42 
 
 		 120 aa  83.6  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  45.88 
 
 		 98 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  43.53 
 
 		 98 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  43.75 
 
 		 131 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  59.02 
 
 		 94 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  31.4 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  44.58 
 
 		 89 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  57.65 
 
 		 134 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  35.51 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  48.68 
 
 		 98 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  43.02 
 
 		 97 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  42.35 
 
 		 91 aa  67  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  42.05 
 
 		 91 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  33.02 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  42.39 
 
 		 97 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  32.43 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  40.48 
 
 		 97 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  32.88 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  31.13 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  34.33 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  33.19 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  41.11 
 
 		 103 aa  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  34.95 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  27.43 
 
 		 227 aa  62  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  42.17 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  35.67 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  35.06 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  33.97 
 
 		 220 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  49.15 
 
 		 80 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  34.21 
 
 		 87 aa  57.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  27.54 
 
 		 209 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>