More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1828 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  100 
 
 		 200 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  87.68 
 
 		 203 aa  347  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  73.17 
 
 		 205 aa  292  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  69.12 
 
 		 206 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  70.1 
 
 		 206 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  70.44 
 
 		 206 aa  284  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  70.44 
 
 		 206 aa  284  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  70.44 
 
 		 206 aa  284  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  70.24 
 
 		 205 aa  284  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  68.63 
 
 		 206 aa  284  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  69.95 
 
 		 206 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  69.95 
 
 		 206 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  69.46 
 
 		 206 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  70.44 
 
 		 206 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  69.76 
 
 		 205 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  67.65 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  67.65 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  67.65 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  67.65 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  67.65 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  67.65 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  67.65 
 
 		 206 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  67.65 
 
 		 206 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  66.16 
 
 		 203 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  64.68 
 
 		 204 aa  254  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  60.1 
 
 		 205 aa  246  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  61.88 
 
 		 214 aa  234  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  57.79 
 
 		 204 aa  228  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  58.91 
 
 		 211 aa  225  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  53.92 
 
 		 210 aa  216  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  55.22 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  54.85 
 
 		 217 aa  214  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  53.43 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  54.85 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  55.88 
 
 		 210 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  54.23 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  52.94 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  55.39 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  56.22 
 
 		 215 aa  208  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  55.17 
 
 		 211 aa  207  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  53.92 
 
 		 210 aa  207  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  60.64 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  53.81 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  48.1 
 
 		 219 aa  202  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  61.62 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  52.29 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  56.1 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  53.2 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  57.81 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  56.35 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  54.68 
 
 		 217 aa  198  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  51.5 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  59.9 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  48.28 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  56.92 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  50 
 
 		 208 aa  187  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  48.99 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  47.47 
 
 		 260 aa  185  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  49.26 
 
 		 222 aa  174  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  51.69 
 
 		 226 aa  173  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  43.14 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  51.21 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  48.54 
 
 		 217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  47.96 
 
 		 230 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  49.21 
 
 		 221 aa  161  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  41.18 
 
 		 213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44.06 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  48.29 
 
 		 688 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  46.31 
 
 		 224 aa  160  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  47.85 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  51.5 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  44.06 
 
 		 211 aa  158  4e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  40.61 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 217 aa  157  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  45.69 
 
 		 230 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.1 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.28 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  45.83 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  41.87 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  46.67 
 
 		 703 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  40.89 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 281 aa  155  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 705 aa  155  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.63 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  45.19 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  44 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.78 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  46.91 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  40.74 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  44.44 
 
 		 688 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  44.9 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 213 aa  152  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.62 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>