More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0437 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0437  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  89.67 
 
 		 239 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  35.98 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  32.8 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 218 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5222  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  34.59 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  29.91 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  22.17 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  41.43 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  41.43 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 184 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  36.27 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  25.55 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  27.18 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  33.05 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1856  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>