More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1572 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  100 
 
 		 212 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  78.77 
 
 		 214 aa  312  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  75.47 
 
 		 210 aa  300  9e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  76.36 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  74.09 
 
 		 218 aa  299  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  74.09 
 
 		 218 aa  299  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  74.55 
 
 		 219 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  66.53 
 
 		 242 aa  276  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  67.13 
 
 		 219 aa  256  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  68.92 
 
 		 217 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  58.16 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  53.91 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  56.09 
 
 		 217 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  56.71 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  50.24 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  50.88 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  60.61 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  50.88 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  60.61 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  53.3 
 
 		 215 aa  197  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  48.33 
 
 		 188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  50 
 
 		 209 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  52.04 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  52.04 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  52.04 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  50.77 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  52.04 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  52.04 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  50.77 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  50.77 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  51.02 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  50.77 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  50.77 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  50.77 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  50.77 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  52.46 
 
 		 179 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  47.49 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  48.18 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  48.18 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  60.15 
 
 		 607 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  51.09 
 
 		 609 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  39.47 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  48.95 
 
 		 240 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  48.67 
 
 		 363 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  44.38 
 
 		 207 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  45.59 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.58 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  46.4 
 
 		 387 aa  108  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  49.02 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40.78 
 
 		 345 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.35 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  49.02 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.16 
 
 		 344 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  50 
 
 		 344 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  50 
 
 		 344 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  50 
 
 		 344 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  43.59 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  45.69 
 
 		 537 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  41.13 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  35.16 
 
 		 344 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  50.94 
 
 		 231 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  40.79 
 
 		 242 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  43.59 
 
 		 294 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  50 
 
 		 344 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  35.98 
 
 		 468 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  53.33 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  39.07 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  42.11 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40.8 
 
 		 350 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40.8 
 
 		 350 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  44.12 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  48.54 
 
 		 266 aa  98.6  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  38.64 
 
 		 227 aa  98.2  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  39.55 
 
 		 367 aa  98.2  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  47.66 
 
 		 294 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  46.79 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  45.54 
 
 		 318 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  47.06 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  42.2 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  43.64 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 		 296 aa  95.9  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.33 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  50 
 
 		 319 aa  95.5  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  47.17 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  42.02 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  42.73 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  39.77 
 
 		 351 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 		 537 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>