More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3627 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  80.92 
 
 		 310 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  80.92 
 
 		 283 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  78.37 
 
 		 282 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  64.81 
 
 		 279 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  63.47 
 
 		 272 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  64.42 
 
 		 279 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  64.79 
 
 		 279 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  63.12 
 
 		 282 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  63.1 
 
 		 295 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  59.85 
 
 		 276 aa  340  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  61.65 
 
 		 269 aa  336  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  58.43 
 
 		 270 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  56.93 
 
 		 275 aa  335  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  60.67 
 
 		 268 aa  335  5e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  58.8 
 
 		 267 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  57.78 
 
 		 275 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  57.41 
 
 		 280 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  58.12 
 
 		 280 aa  325  6e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  56.13 
 
 		 290 aa  323  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  56 
 
 		 280 aa  322  6e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  54.15 
 
 		 280 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  56.09 
 
 		 271 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  53.53 
 
 		 273 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  51.1 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  52.06 
 
 		 290 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  55.19 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  52.06 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  50.73 
 
 		 275 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  49.82 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  52.06 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  50.56 
 
 		 278 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  54.04 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  52.61 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  53.7 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  51.67 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  51.67 
 
 		 270 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  48.47 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  40.46 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  48.15 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  38.91 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  37.92 
 
 		 265 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 		 266 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  37.39 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  34.78 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  40.08 
 
 		 281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  35.07 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  40.08 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  39.57 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  43.41 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  35.52 
 
 		 286 aa  148  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  34.62 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  35.51 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  40.7 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  40.94 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  36.8 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  32.08 
 
 		 286 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  32.08 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  32.83 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  33.85 
 
 		 285 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  31.7 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  33.77 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  41.12 
 
 		 367 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  34.11 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  41.28 
 
 		 257 aa  118  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  37.44 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  34.29 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  37.74 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  30.27 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  33.15 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  31.88 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  34.71 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  36.67 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  32.78 
 
 		 261 aa  95.5  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  36.65 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  33.16 
 
 		 289 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  36.14 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  31.16 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  31.16 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  31.16 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  35.12 
 
 		 269 aa  85.9  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  30.62 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  35.25 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  28.82 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  26.58 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  33.05 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  28.77 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  28.82 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  34.35 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  35.65 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  29.22 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11441  transglutaminase-like superfamily protein  31.73 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1051  transglutaminase-like  31.73 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.647734  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11451  transglutaminase-like superfamily protein  31.73 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  27.54 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  30.28 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  27.97 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  35.59 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>