More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0112 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 789 aa  1608    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  53.02 
 
 		 773 aa  806    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  68.25 
 
 		 795 aa  1062    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  53.15 
 
 		 773 aa  805    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  69.45 
 
 		 772 aa  1055    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  54.06 
 
 		 771 aa  806    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  51.03 
 
 		 766 aa  793    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  88.24 
 
 		 789 aa  1415    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  50.32 
 
 		 771 aa  769    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  79.85 
 
 		 775 aa  1251    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  37.35 
 
 		 711 aa  336  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  32.35 
 
 		 672 aa  317  6e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  33.43 
 
 		 655 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  33.1 
 
 		 698 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  30.15 
 
 		 686 aa  241  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  31.09 
 
 		 731 aa  212  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  31.28 
 
 		 668 aa  210  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  29.74 
 
 		 676 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  31.42 
 
 		 680 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  28.87 
 
 		 677 aa  204  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  30.85 
 
 		 573 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  30.43 
 
 		 680 aa  194  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  26.29 
 
 		 640 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  28.16 
 
 		 753 aa  180  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  30.34 
 
 		 550 aa  114  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  26.71 
 
 		 691 aa  105  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  32.67 
 
 		 725 aa  105  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.32 
 
 		 739 aa  105  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.31 
 
 		 719 aa  103  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.8 
 
 		 704 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.49 
 
 		 740 aa  101  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  39.04 
 
 		 639 aa  101  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  46.56 
 
 		 749 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  32.9 
 
 		 580 aa  100  8e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  38.19 
 
 		 744 aa  100  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.5 
 
 		 742 aa  99.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.69 
 
 		 755 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.18 
 
 		 742 aa  99.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.93 
 
 		 740 aa  99.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.1 
 
 		 743 aa  99.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.14 
 
 		 763 aa  99  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.8 
 
 		 718 aa  98.6  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  39.44 
 
 		 570 aa  98.6  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.23 
 
 		 754 aa  97.8  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  27.57 
 
 		 764 aa  97.8  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.11 
 
 		 801 aa  97.8  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  42.18 
 
 		 653 aa  97.8  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  25.83 
 
 		 703 aa  97.4  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  42.18 
 
 		 657 aa  97.4  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.23 
 
 		 738 aa  97.8  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.44 
 
 		 727 aa  97.4  9e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  37.62 
 
 		 634 aa  97.4  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  41.35 
 
 		 662 aa  96.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.43 
 
 		 806 aa  96.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  28.31 
 
 		 763 aa  96.3  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  41.13 
 
 		 787 aa  96.3  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  41.04 
 
 		 305 aa  96.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  26.56 
 
 		 713 aa  95.5  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  38.02 
 
 		 743 aa  95.9  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.99 
 
 		 757 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.64 
 
 		 805 aa  95.9  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  37.25 
 
 		 570 aa  95.1  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  37.25 
 
 		 570 aa  95.1  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  37.25 
 
 		 570 aa  94.7  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  26.57 
 
 		 699 aa  94.4  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  38.93 
 
 		 442 aa  94.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  38.46 
 
 		 569 aa  94.4  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  25.15 
 
 		 754 aa  94  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  27.91 
 
 		 722 aa  94  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  42.22 
 
 		 652 aa  94  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.1 
 
 		 757 aa  94  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 		 656 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  28.33 
 
 		 803 aa  93.2  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.7 
 
 		 736 aa  93.2  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  42.55 
 
 		 656 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.41 
 
 		 754 aa  92.4  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  40.46 
 
 		 1085 aa  92  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  35.98 
 
 		 578 aa  91.7  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.46 
 
 		 756 aa  91.7  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  43.7 
 
 		 665 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 		 810 aa  90.5  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.17 
 
 		 801 aa  89.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  33.33 
 
 		 478 aa  89.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  36.73 
 
 		 697 aa  89.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  38.64 
 
 		 617 aa  90.1  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  37.67 
 
 		 577 aa  89  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.03 
 
 		 772 aa  89  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.4 
 
 		 738 aa  89  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.74 
 
 		 754 aa  89  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.69 
 
 		 768 aa  88.6  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.79 
 
 		 773 aa  88.6  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.7 
 
 		 757 aa  88.2  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  40.74 
 
 		 444 aa  87.8  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.14 
 
 		 754 aa  87.8  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  36.81 
 
 		 680 aa  87.4  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  24.06 
 
 		 721 aa  87.4  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.21 
 
 		 810 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4753  AAA ATPase central domain protein  25 
 
 		 646 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.32 
 
 		 721 aa  87  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  41.18 
 
 		 682 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>