More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0482 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
167 aa  338  2.9999999999999998e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  68.1 
 
 
169 aa  230  7.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  59.88 
 
 
168 aa  202  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  63.52 
 
 
163 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  56.63 
 
 
168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  55 
 
 
164 aa  177  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1775  lipoprotein signal peptidase  54.14 
 
 
159 aa  158  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 
145 aa  94.4  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  41.22 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
161 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  40.51 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 
160 aa  90.9  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.16 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 
155 aa  89  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  31.28 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  30.23 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  41.54 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  32.16 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  36 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  36.09 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  31.61 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  30.81 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  39.84 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  31.61 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  39.23 
 
 
171 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 
173 aa  72  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
272 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 
153 aa  72  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  37.25 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
224 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  34.42 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  38.58 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  32.85 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  34.48 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  33.73 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  33.73 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  33.96 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  33.73 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  39.47 
 
 
123 aa  70.5  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  33.73 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  35.12 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  33.73 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02475  putative signal peptidase  28.92 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248092  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  35.98 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  35.98 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  33.61 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  35.98 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  30.13 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  33.94 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  30.86 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2334  lipoprotein signal peptidase  30.25 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000924043  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>