More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2384 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  100 
 
 		 549 aa  1067    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  59.11 
 
 		 543 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  57.74 
 
 		 549 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  57.23 
 
 		 539 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  48.76 
 
 		 532 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  50.75 
 
 		 560 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  48.47 
 
 		 535 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  55.68 
 
 		 529 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  48.77 
 
 		 553 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  47.59 
 
 		 532 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  49.9 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  44.91 
 
 		 553 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  48.64 
 
 		 551 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  50.1 
 
 		 526 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  49.04 
 
 		 529 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  48.85 
 
 		 535 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  47.78 
 
 		 532 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  48.65 
 
 		 528 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  47.54 
 
 		 542 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  45.68 
 
 		 539 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  44.32 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  43.35 
 
 		 539 aa  379  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  41.32 
 
 		 586 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  44.32 
 
 		 519 aa  359  6e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  43.16 
 
 		 569 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  43.16 
 
 		 569 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  43.64 
 
 		 536 aa  356  6.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  41.67 
 
 		 530 aa  355  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  39.81 
 
 		 551 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  41.92 
 
 		 542 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  40.92 
 
 		 536 aa  340  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  38.61 
 
 		 541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  41.52 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  39.03 
 
 		 542 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  38.83 
 
 		 542 aa  330  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  42.83 
 
 		 574 aa  330  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  37.52 
 
 		 542 aa  326  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  38.34 
 
 		 542 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  38.7 
 
 		 543 aa  316  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  39.81 
 
 		 533 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  39.81 
 
 		 533 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  39.63 
 
 		 533 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  40.22 
 
 		 541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  35.51 
 
 		 527 aa  305  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  40.52 
 
 		 557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  34.47 
 
 		 572 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  34.35 
 
 		 571 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  35.65 
 
 		 532 aa  296  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  40.88 
 
 		 541 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  40.69 
 
 		 541 aa  290  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  41.65 
 
 		 561 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  38.88 
 
 		 544 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  34.73 
 
 		 555 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  35.46 
 
 		 562 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  35.66 
 
 		 562 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  33.58 
 
 		 554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  36.53 
 
 		 533 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  35.8 
 
 		 562 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  34.01 
 
 		 560 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  38.48 
 
 		 419 aa  249  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  41.83 
 
 		 409 aa  232  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  36.46 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  35.98 
 
 		 433 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  38.78 
 
 		 433 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  38.78 
 
 		 433 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  38.46 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  38.5 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  38.5 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  38.5 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  38.5 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 474 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 447 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  30.41 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 423 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 453 aa  171  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 440 aa  171  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 441 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  32.63 
 
 		 446 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  31.41 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 474 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 432 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 436 aa  163  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 413 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 412 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  26.01 
 
 		 410 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  31.3 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>