191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0046 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  100 
 
 
1066 aa  2134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.07412e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  27.64 
 
 
1369 aa  154  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  27.2 
 
 
986 aa  125  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  26.71 
 
 
995 aa  119  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  29.9 
 
 
1458 aa  119  4e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  27.5 
 
 
1028 aa  117  1e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  3.68637e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  25.58 
 
 
1001 aa  114  8e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  29.52 
 
 
1459 aa  113  2e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  25.54 
 
 
1001 aa  112  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.4 
 
 
1322 aa  110  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  6.38249e-09 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  29.12 
 
 
991 aa  109  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  28.9 
 
 
995 aa  109  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  27.84 
 
 
1119 aa  108  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  24.68 
 
 
1004 aa  107  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  36.44 
 
 
812 aa  106  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.67 
 
 
1285 aa  107  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  34.33 
 
 
368 aa  106  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  26.96 
 
 
1055 aa  106  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  26.15 
 
 
650 aa  104  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  35.4 
 
 
1202 aa  101  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  23.94 
 
 
1769 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  26.49 
 
 
983 aa  100  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  32.66 
 
 
1096 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.29 
 
 
972 aa  99  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  23.91 
 
 
1033 aa  99  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  27.06 
 
 
1038 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  27.23 
 
 
985 aa  97.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.5 
 
 
1011 aa  97.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.52 
 
 
919 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  26.04 
 
 
990 aa  91.7  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  29.91 
 
 
354 aa  91.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.72 
 
 
1489 aa  91.3  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  28.74 
 
 
1025 aa  89  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  30.86 
 
 
619 aa  89  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.12 
 
 
1227 aa  87.8  1e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.87 
 
 
1029 aa  86.7  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  27.14 
 
 
1236 aa  85.1  6e-15  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  28.4 
 
 
1130 aa  82.4  4e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  27.73 
 
 
725 aa  82.4  4e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  26.57 
 
 
1550 aa  80.9  1e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  25.45 
 
 
1156 aa  80.9  1e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  31.82 
 
 
475 aa  81.3  1e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 
1134 aa  80.5  2e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  26.63 
 
 
1154 aa  80.5  2e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  31.02 
 
 
1092 aa  80.5  2e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  28.37 
 
 
1508 aa  79.7  3e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  27.46 
 
 
2848 aa  79.3  4e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  27.31 
 
 
424 aa  79  5e-13  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  24.38 
 
 
1179 aa  79  5e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  25.4 
 
 
959 aa  78.6  6e-13  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.97 
 
 
1125 aa  77.4  1e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  25.95 
 
 
1152 aa  77  2e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3913  outer membrane autotransporter  25.69 
 
 
1091 aa  75.9  4e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  26.4 
 
 
1129 aa  72.8  3e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  26.4 
 
 
1129 aa  72.8  3e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  26.4 
 
 
1131 aa  72.4  4e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  26.4 
 
 
1131 aa  72.4  4e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  26.4 
 
 
1131 aa  72.4  4e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  26.4 
 
 
1131 aa  72.4  4e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  26.65 
 
 
965 aa  72  6e-11  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  27.54 
 
 
994 aa  71.6  8e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1208  outer membrane autotransporter TapA  28.5 
 
 
991 aa  71.2  1e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  26.09 
 
 
942 aa  70.9  1e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4995  predicted protein  29.2 
 
 
241 aa  70.1  2e-10  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  36.04 
 
 
987 aa  70.5  2e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.04 
 
 
1848 aa  69.7  3e-10  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  26.3 
 
 
1782 aa  69.7  3e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  26.53 
 
 
974 aa  68.6  6e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  37.02 
 
 
1180 aa  67.8  1e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  26.75 
 
 
1131 aa  67  2e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.38 
 
 
1673 aa  67  2e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.42 
 
 
1081 aa  67.4  2e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  26.64 
 
 
360 aa  67  2e-09  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  25.47 
 
 
816 aa  66.6  3e-09  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  26.91 
 
 
882 aa  66.2  3e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  27.19 
 
 
909 aa  65.9  4e-09  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.71 
 
 
926 aa  65.5  6e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.56 
 
 
774 aa  65.1  7e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  24.54 
 
 
1881 aa  64.7  8e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.55 
 
 
1242 aa  65.1  8e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  23.91 
 
 
1016 aa  64.7  1e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  24.89 
 
 
759 aa  63.9  2e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  26.87 
 
 
305 aa  63.9  2e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0728  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.01 
 
 
1256 aa  62.8  3e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.23429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  30.97 
 
 
989 aa  62.4  5e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  23.59 
 
 
2003 aa  62  6e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  28.85 
 
 
2353 aa  62  6e-08  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9664  predicted protein  26.36 
 
 
259 aa  61.6  8e-08  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.345289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  24.44 
 
 
763 aa  61.2  9e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39605  predicted protein  23.81 
 
 
316 aa  61.2  9e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  25.3 
 
 
1177 aa  61.2  1e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45795  predicted protein  26.75 
 
 
666 aa  60.8  1e-07  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  27.19 
 
 
677 aa  60.8  1e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  24.64 
 
 
1333 aa  60.1  2e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  28.02 
 
 
789 aa  60.5  2e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  22.8 
 
 
1068 aa  60.1  2e-07  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.59 
 
 
915 aa  59.7  3e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  28.05 
 
 
594 aa  58.9  5e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  24.83 
 
 
571 aa  58.9  5e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  27.4 
 
 
934 aa  58.9  5e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>