More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1325 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  61.36 
 
 		 710 aa  809    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  56.52 
 
 		 686 aa  791    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  73.41 
 
 		 688 aa  1040    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  62.42 
 
 		 687 aa  820    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  57.42 
 
 		 676 aa  786    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  61.68 
 
 		 713 aa  809    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  61.7 
 
 		 745 aa  818    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  61.7 
 
 		 745 aa  818    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  58.07 
 
 		 687 aa  781    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  62.04 
 
 		 745 aa  824    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  64.15 
 
 		 726 aa  878    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  62.16 
 
 		 749 aa  824    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  72.61 
 
 		 710 aa  1048    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  59.63 
 
 		 684 aa  815    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 719 aa  1479    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  61.06 
 
 		 710 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  56.38 
 
 		 681 aa  790    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  62.5 
 
 		 753 aa  830    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  56.52 
 
 		 681 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  57.27 
 
 		 676 aa  782    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  73.27 
 
 		 688 aa  1040    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  58.22 
 
 		 669 aa  785    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  55.6 
 
 		 724 aa  756    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  61.36 
 
 		 710 aa  809    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  62.16 
 
 		 749 aa  825    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  72.83 
 
 		 688 aa  1032    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  57.71 
 
 		 698 aa  736    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  62.27 
 
 		 709 aa  818    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  57.56 
 
 		 725 aa  735    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  98.61 
 
 		 723 aa  1462    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  61.36 
 
 		 710 aa  809    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  61.7 
 
 		 745 aa  818    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  72.69 
 
 		 688 aa  1038    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  50 
 
 		 691 aa  650    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  46.91 
 
 		 686 aa  576  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  39.36 
 
 		 662 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  40.64 
 
 		 661 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  40.09 
 
 		 667 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  38.82 
 
 		 663 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  37.93 
 
 		 668 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  38.74 
 
 		 668 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  39.12 
 
 		 668 aa  415  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  36.76 
 
 		 667 aa  405  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 672 aa  326  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  33.74 
 
 		 695 aa  319  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.44 
 
 		 665 aa  285  3.0000000000000004e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 697 aa  239  9e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 699 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 681 aa  200  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 668 aa  165  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  25.6 
 
 		 699 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 702 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 702 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 702 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 661 aa  145  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 760 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 673 aa  142  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 768 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 696 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 718 aa  115  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 713 aa  112  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 708 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  26.31 
 
 		 701 aa  107  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 685 aa  107  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 684 aa  107  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 713 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 713 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 716 aa  105  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 698 aa  104  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  22.87 
 
 		 708 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 705 aa  102  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.89 
 
 		 625 aa  101  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 780 aa  99.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 741 aa  95.9  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 713 aa  95.5  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 750 aa  94.4  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 714 aa  94.4  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 775 aa  94  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 769 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 685 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  26.42 
 
 		 712 aa  86.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  23.58 
 
 		 775 aa  80.1  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  30.18 
 
 		 764 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 721 aa  79.7  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  48.61 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 744 aa  77.4  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 683 aa  77  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  29.36 
 
 		 861 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  30.18 
 
 		 764 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 766 aa  74.7  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.26 
 
 		 862 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  21.71 
 
 		 656 aa  74.3  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.05 
 
 		 867 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05130  hypothetical protein  24.88 
 
 		 248 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.96 
 
 		 862 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.96 
 
 		 862 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.96 
 
 		 759 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 749 aa  70.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 713 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.59 
 
 		 750 aa  69.3  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>