170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0148 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  38.23 
 
 		 1211 aa  784    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  38.26 
 
 		 1209 aa  761    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  38.24 
 
 		 1209 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  40.31 
 
 		 1218 aa  794    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  37.88 
 
 		 1208 aa  746    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  38.09 
 
 		 1209 aa  761    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  41.22 
 
 		 1199 aa  859    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  32.75 
 
 		 1181 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  35.26 
 
 		 1182 aa  715    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  40.13 
 
 		 1205 aa  751    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  99 
 
 		 1102 aa  2193    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  100 
 
 		 1176 aa  2367    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  38.97 
 
 		 1209 aa  786    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  38.26 
 
 		 1209 aa  761    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  35.26 
 
 		 1207 aa  649    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  38.26 
 
 		 1209 aa  761    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  36.01 
 
 		 1172 aa  732    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  37.79 
 
 		 1212 aa  739    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  38.26 
 
 		 1209 aa  760    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  38.26 
 
 		 1209 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  38.26 
 
 		 1209 aa  761    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  41.86 
 
 		 1220 aa  807    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  78.16 
 
 		 1171 aa  1864    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  37.21 
 
 		 1175 aa  674    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  34.02 
 
 		 1181 aa  598  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  30.93 
 
 		 1164 aa  565  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  31.72 
 
 		 1302 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  31.75 
 
 		 1302 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  31.83 
 
 		 1302 aa  559  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  34.38 
 
 		 1176 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  32.36 
 
 		 1302 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  31.33 
 
 		 1302 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  35.11 
 
 		 1148 aa  528  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1173 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  33.92 
 
 		 1204 aa  523  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  32.66 
 
 		 1173 aa  516  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  33.81 
 
 		 1152 aa  509  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  31.01 
 
 		 1302 aa  505  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  30.67 
 
 		 1268 aa  503  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  30.85 
 
 		 1157 aa  482  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  30.59 
 
 		 1329 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  29.95 
 
 		 1348 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  31.84 
 
 		 1179 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  31.46 
 
 		 1289 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  31.38 
 
 		 1289 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  31.13 
 
 		 1289 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  31.21 
 
 		 1289 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1179 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1192 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1175 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1168 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  29.92 
 
 		 1175 aa  413  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  26.67 
 
 		 1182 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  25.47 
 
 		 1187 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1195 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1332 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  30.6 
 
 		 1365 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  30.76 
 
 		 1365 aa  396  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1275 aa  386  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1369 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  26.24 
 
 		 1275 aa  386  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  28.56 
 
 		 1317 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  31.36 
 
 		 1358 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  31.36 
 
 		 1358 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  31.36 
 
 		 1358 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1208 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1164 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  25.42 
 
 		 1164 aa  358  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 1194 aa  357  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  30.26 
 
 		 1366 aa  354  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  27.91 
 
 		 1230 aa  350  9e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1206 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  27.44 
 
 		 1165 aa  345  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1008 aa  345  4e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  27.44 
 
 		 1206 aa  343  9e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  26.62 
 
 		 1150 aa  342  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1270 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  26.36 
 
 		 1165 aa  337  9e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  27.9 
 
 		 1194 aa  335  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  26.23 
 
 		 1177 aa  330  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  26.23 
 
 		 1177 aa  330  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  28.28 
 
 		 1205 aa  328  4.0000000000000003e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  26.77 
 
 		 1288 aa  323  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  25.15 
 
 		 1165 aa  319  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1167 aa  290  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1167 aa  290  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1167 aa  289  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1167 aa  289  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  26.58 
 
 		 1164 aa  288  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1147 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  25.82 
 
 		 1153 aa  268  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1104 aa  265  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  32.59 
 
 		 1315 aa  265  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1174 aa  263  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1153 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1174 aa  261  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1297 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  35.68 
 
 		 1313 aa  255  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1297 aa  255  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1297 aa  255  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>