More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16603 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  100 
 
 		 599 aa  1229    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  53.18 
 
 		 623 aa  646    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  53.14 
 
 		 1072 aa  629  1e-179  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  50.41 
 
 		 997 aa  604  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  50.66 
 
 		 1228 aa  593  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  38.67 
 
 		 601 aa  382  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  39.15 
 
 		 594 aa  365  2e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  36.13 
 
 		 589 aa  362  9e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  36.42 
 
 		 592 aa  356  5.999999999999999e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  34.6 
 
 		 588 aa  356  6.999999999999999e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  35.47 
 
 		 592 aa  355  1e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  35.34 
 
 		 602 aa  355  2e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  36.99 
 
 		 597 aa  352  8.999999999999999e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  35.88 
 
 		 599 aa  343  7e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  35.47 
 
 		 598 aa  342  2e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  35.08 
 
 		 600 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  35.24 
 
 		 598 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  35.19 
 
 		 598 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  34.56 
 
 		 604 aa  333  8e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  34.72 
 
 		 597 aa  332  8e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  35.37 
 
 		 589 aa  332  1e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  35.28 
 
 		 578 aa  329  8e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  34.27 
 
 		 591 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  36.29 
 
 		 593 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  34.35 
 
 		 598 aa  324  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  36.25 
 
 		 607 aa  323  5e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  34.33 
 
 		 598 aa  320  3e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  36.24 
 
 		 602 aa  320  6e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  34.46 
 
 		 604 aa  319  7e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  33.16 
 
 		 591 aa  319  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  34.46 
 
 		 591 aa  314  3.9999999999999997e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  33.85 
 
 		 593 aa  310  5e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  33.73 
 
 		 593 aa  301  3e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  32.47 
 
 		 656 aa  156  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  30.56 
 
 		 882 aa  153  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  31.13 
 
 		 885 aa  150  8e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  29.15 
 
 		 854 aa  147  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  30.72 
 
 		 903 aa  147  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  28.78 
 
 		 871 aa  146  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  28.57 
 
 		 871 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  27.97 
 
 		 877 aa  146  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  28.86 
 
 		 968 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  29.72 
 
 		 970 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  29.68 
 
 		 992 aa  144  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  29.62 
 
 		 903 aa  143  8e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  30.14 
 
 		 984 aa  143  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  28.13 
 
 		 965 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  29.5 
 
 		 920 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  27.96 
 
 		 896 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  28.01 
 
 		 885 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  29.32 
 
 		 1104 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  29.49 
 
 		 985 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  28.01 
 
 		 881 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  29.92 
 
 		 838 aa  141  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  28.27 
 
 		 882 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  29.59 
 
 		 966 aa  140  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  29.33 
 
 		 917 aa  140  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  28.33 
 
 		 882 aa  140  8.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  28.93 
 
 		 964 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  28.28 
 
 		 884 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  29.64 
 
 		 905 aa  139  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  28.54 
 
 		 689 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  29.77 
 
 		 897 aa  140  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  30.77 
 
 		 888 aa  138  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0255  translation initiation factor IF-2  26.5 
 
 		 700 aa  139  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.405261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  30.46 
 
 		 978 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  29.65 
 
 		 843 aa  139  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  28.87 
 
 		 908 aa  139  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  29.2 
 
 		 904 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  30.29 
 
 		 964 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  29.34 
 
 		 845 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  28.57 
 
 		 1101 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  28.54 
 
 		 1113 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0371  translation initiation factor IF-2  27.98 
 
 		 896 aa  137  4e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 		 854 aa  137  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0203  translation initiation factor IF-2  29.79 
 
 		 892 aa  138  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.665385  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  27.87 
 
 		 1005 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  26.92 
 
 		 1042 aa  137  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0179  translation initiation factor IF-2  29.79 
 
 		 892 aa  137  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.61877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  30.02 
 
 		 964 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2815  translation initiation factor IF-2  27.83 
 
 		 883 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  28.17 
 
 		 848 aa  137  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10835  predicted protein  29.07 
 
 		 579 aa  137  7.000000000000001e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  28.68 
 
 		 908 aa  137  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  29.32 
 
 		 874 aa  137  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  27.46 
 
 		 992 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  29.58 
 
 		 975 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  29.58 
 
 		 975 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  29.71 
 
 		 972 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  29.58 
 
 		 975 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  29.58 
 
 		 975 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  29.76 
 
 		 1183 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  29.58 
 
 		 975 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  29.58 
 
 		 975 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  28.43 
 
 		 686 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  29.66 
 
 		 880 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  29.79 
 
 		 975 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  28.95 
 
 		 979 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  26.99 
 
 		 898 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  27.46 
 
 		 992 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>