127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_66700 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  100 
 
 		 255 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  93.33 
 
 		 255 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  57.54 
 
 		 267 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  55.56 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  56.86 
 
 		 266 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  55.56 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  54.76 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  54.76 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  53.78 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  54.9 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  38.82 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  35.32 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  35.78 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  35.08 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  29.71 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  30.23 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  31.07 
 
 		 276 aa  89.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  25.1 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  28.04 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  30.04 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  33.33 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  29.44 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  31.64 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  37.5 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  26.58 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  35.62 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  33.83 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  26.92 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  26.92 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  31.47 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  27.56 
 
 		 178 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  31.08 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  32.11 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  28.95 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  29.93 
 
 		 237 aa  62  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  25.14 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  29.5 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  32.87 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  31.43 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  30.19 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  35.85 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  31.48 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  30.05 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  31.54 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  33.79 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  33.83 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  29.22 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  32.08 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2380  nuclease (SNase domain protein)  34.16 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00295748  normal  0.102212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0553  nuclease (SNase-like)  30.09 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117842  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  33.2 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  27.46 
 
 		 186 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  26.71 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  29.91 
 
 		 350 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  35.37 
 
 		 301 aa  52  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  30.1 
 
 		 374 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  29.76 
 
 		 282 aa  52  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  28.57 
 
 		 187 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  31.82 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  29.41 
 
 		 157 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0407  nuclease (SNase-like)  29.25 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  32.19 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  29.23 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  26.97 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  26.36 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  26.32 
 
 		 174 aa  49.7  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  26.28 
 
 		 351 aa  49.7  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  34 
 
 		 155 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  25.32 
 
 		 192 aa  48.5  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  33.07 
 
 		 136 aa  48.5  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  30.47 
 
 		 388 aa  48.5  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3627  hypothetical protein  31.98 
 
 		 283 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  0.3305 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0030  thermonuclease family protein  24.46 
 
 		 214 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0694892  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  28.4 
 
 		 183 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  30.3 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  25.55 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf871  nuclease, lipoprotein  25.15 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  29.32 
 
 		 166 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  26.8 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 124 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  27.69 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  31.08 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  33.33 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  25.5 
 
 		 183 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  29.63 
 
 		 148 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  23.66 
 
 		 175 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  35.56 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3161  nuclease  26.34 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  25.76 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  31.78 
 
 		 158 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  24.43 
 
 		 175 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  26.9 
 
 		 227 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  29.41 
 
 		 323 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  23.66 
 
 		 175 aa  46.2  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  21.92 
 
 		 183 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  28.35 
 
 		 408 aa  46.2  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  29.41 
 
 		 180 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  26.17 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  28.48 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  22.82 
 
 		 183 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>